RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	CTR9	Q6PD62	1173 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	WDR62	O43379	1518 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	C14orf37	Q86TY3	774 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	OGFR	Q9NZT2	677 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	DEF6	Q9H4E7	631 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	GOLGA2	Q08379	1002 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	CERS3	Q8IU89	383 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	NUCB2	P80303	420 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	CNPY4	Q8N129	248 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	MCTP1	Q6DN14	999 aa		10.02	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		10.02	□□□□□ -0.8
CRNKL1-205	ENST00000496549	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	TPM3	P06753	285 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIF16B	Q96L93	1317 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	P3H3	Q8IVL6	736 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	DRC7	Q8IY82	874 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF214	Q8ND24	703 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	FMN1	Q68DA7	1419 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPATCH11	Q8N954	259 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRT222	Q8N1A0	295 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	RGS22	Q8NE09	1264 aa		10	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		10	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	UACA	Q9BZF9	1416 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	BANK1	Q8NDB2	785 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	CUX1	P39880	1505 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	EFCC1	Q9HA90	598 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	MBD3	O95983	291 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	CFAP44	Q96MT7	982 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZBTB22	O15209	634 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	9.98	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	TSPY26P	Q9H489	355 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	NCOA1	Q15788	1441 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	9.97	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	MAP3K1	Q13233	1512 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	NRDC	O43847	1150 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	IFT140	Q96RY7	1462 aa		9.96	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		9.96	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	NCOA2	Q15596	1464 aa		9.96	□□□□□ -0.81
CRNKL1-205	ENST00000496549	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		9.96	□□□□□ -0.82
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
CRNKL1-205	ENST00000496549	TPM4	P67936	248 aa		9.96	□□□□□ -0.82
CRNKL1-205	ENST00000496549	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		9.96	□□□□□ -0.82
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	9.95	□□□□□ -0.82
CRNKL1-205	ENST00000496549	CASC1	Q6TDU7	716 aa		9.95	□□□□□ -0.82
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF592	Q92610	1267 aa		9.95	□□□□□ -0.82
CRNKL1-205	ENST00000496549	PANK3	Q9H999	370 aa		9.95	□□□□□ -0.82
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC20A2	Q08357	652 aa		9.95	□□□□□ -0.82
CRNKL1-205	ENST00000496549	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		9.95	□□□□□ -0.82
CRNKL1-205	ENST00000496549	COG6	Q9Y2V7	657 aa		9.95	□□□□□ -0.82
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		9.94	□□□□□ -0.82
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		9.94	□□□□□ -0.82
CRNKL1-205	ENST00000496549	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	9.94	□□□□□ -0.82
CRNKL1-205	ENST00000496549	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		9.94	□□□□□ -0.82
CRNKL1-205	ENST00000496549	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	9.94	□□□□□ -0.82
CRNKL1-205	ENST00000496549	IFT57	Q9NWB7	429 aa		9.94	□□□□□ -0.82
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	9.94	□□□□□ -0.82
CRNKL1-205	ENST00000496549	TDO2	P48775	406 aa		9.94	□□□□□ -0.82
CRNKL1-205	ENST00000496549	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		9.94	□□□□□ -0.82
CRNKL1-205	ENST00000496549	AK7	Q96M32	723 aa		9.94	□□□□□ -0.82
CRNKL1-205	ENST00000496549	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		9.94	□□□□□ -0.82
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		9.93	□□□□□ -0.82
CRNKL1-205	ENST00000496549	YY1AP1	Q9H869	796 aa		9.93	□□□□□ -0.82
CRNKL1-205	ENST00000496549		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	9.92	□□□□□ -0.82

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.2 ms