RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa6.98□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 WDR70Q9NW82 654 aa6.98□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 A2ML1A8K2U0 1454 aa6.98□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 MLH3Q9UHC1 1453 aa6.98□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 LRRC7Q96NW7 1537 aa6.97□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 IQGAP1P46940 1657 aa6.97□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa6.97□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 ITSN2Q9NZM3 1697 aa6.96□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 AFAP1Q8N556 730 aa6.96□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 CABP2Q9NPB3 220 aa6.96□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 PHF8Q9UPP1 1060 aa6.96□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 DEPDC5O75140 1603 aa6.96□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 TRIM52Q96A61 297 aa6.95□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGAP5Q13017 1502 aa6.95□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa6.94□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 MS4A4AQ96JQ5 239 aa6.94□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 PHLPP1O60346 1717 aa6.93□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa6.93□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 MED14O60244 1454 aa6.93□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.93□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM135BQ49AJ0 1406 aa6.93□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 KIF14Q15058 1648 aa6.92□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 CD44P16070 742 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 MFSD10Q14728 455 aa6.92□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 E2F4Q16254 413 aa6.92□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 LMOD2Q6P5Q4 547 aa6.92□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 ZRANB1Q9UGI0 708 aa6.92□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa6.91□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 ABCC1P33527 1531 aa6.91□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 PHF12Q96QT6 1004 aa6.9□□□□□ -1.3
ECHDC1-211ENST00000460558 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa6.9□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 RXRBP28702 533 aa6.89□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 JCADQ9P266 1359 aa6.89□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 PRXQ9BXM0 1461 aa6.89□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 PREX2Q70Z35 1606 aa6.89□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 PLXNC1O60486 1568 aa6.88□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 UGGT1Q9NYU2 1555 aa6.88□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM135AQ9P2D6 1515 aa6.88□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.88□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 IFFO2Q5TF58 517 aa6.88□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 LRP5O75197 1615 aa6.87□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 TNRQ92752 1358 aa6.87□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 C19orf67A6NJJ6 358 aa6.87□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 CAMK2BQ13554 666 aa6.87□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 ADGBQ8N7X0 1667 aa6.87□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 KDM5DQ9BY66 1539 aa6.86□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 PDE4AP27815 886 aa6.86□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM106CQ9BVX2 250 aa6.86□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 SHPRHQ149N8 1683 aa6.86□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 LRP6O75581 1613 aa6.86□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa6.86□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 NLRP1Q9C000 1473 aa6.85□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa6.85□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.85□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 GGT6Q6P531 493 aa6.85□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 MS4A3Q96HJ5 214 aa6.85□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 TRPC6Q9Y210 931 aa6.85□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 ATP7AQ04656 1500 aa6.85□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 CLIP1P30622 1438 aa6.84□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa6.84□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 SEMA3EO15041 775 aa6.84□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 TIE1P35590 1138 aa6.84□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 A2MP01023 1474 aa6.84□□□□□ -1.31
ECHDC1-211ENST00000460558 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 PZPP20742 1482 aa6.83□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 RGS12O14924 1447 aa6.83□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 FGD6Q6ZV73 1430 aa6.83□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 ATAD2Q6PL18 1390 aa6.82□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 GOLGA2Q08379 1002 aa6.81□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.8□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 TIAM1Q13009 1591 aa6.8□□□□□ -1.32
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