RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430930.5

TNS1-207, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-207ENST00000430930 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa16.07■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 TPM1P09493 284 aa16.06■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 CREBRFQ8IUR6 639 aa16.06■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.06■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 FGD6Q6ZV73 1430 aa16.06■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 VPS53Q5VIR6 699 aa16.06■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 RUNDC1Q96C34 613 aa16.06■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 EXOC6Q8TAG9 804 aa16.04■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 TRIM29Q14134 588 aa16.04■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 FYCO1Q9BQS8 1478 aa16.03■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa16.03■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 RNF20Q5VTR2 975 aa16.03■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.03■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 BECN2A8MW95 431 aa16.02■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 COG6Q9Y2V7 657 aa16.02■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 BCL2L13Q9BXK5 485 aa16.02■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 APAF1O14727 1248 aa16.02■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 RIPK4P57078 832 aa16.02■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 GNAI1P63096 354 aa16.02■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 PRDM2Q13029 1718 aa16.01■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 CNTLNQ9NXG0 1405 aa16.01■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 CCDC70Q6NSX1 233 aa16■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 PLIN1O60240 522 aa16■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 TRIM34Q9BYJ4 488 aa16■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 ANO2Q9NQ90 1003 aa16■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 CCDC7Q96M83 1385 aa15.99■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 PES1O00541 588 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 PSME1Q06323 249 aa15.98■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.153e-8■■□□□ 11.5
TNS1-207ENST00000430930 GSE1Q14687 1217 aa15.98■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 IGF1RP08069 1367 aa15.98■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 OSCARQ8IYS5 282 aa15.98■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 ERC2O15083 957 aa15.98■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.98■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa15.98■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa15.97■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 MCTP1Q6DN14 999 aa15.97■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 FANCIQ9NVI1 1328 aa15.97■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 TRDNQ13061 729 aa15.97■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 GPS2Q13227 327 aa15.97■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 RSPH6AQ9H0K4 717 aa15.96■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 CHMP5Q9NZZ3 219 aa15.96■□□□□ 0.15
TNS1-207ENST00000430930 CPLX1O14810 134 aa15.96■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa15.95■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 PRM3Q9NNZ6 103 aa15.95■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 KIF21BO75037 1637 aa15.95■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 WWC1Q8IX03 1113 aa15.95■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa15.95■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 NUCB2P80303 420 aa15.95■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 SCAPERQ9BY12 1400 aa15.94■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 ERICH2A1L162 156 aa15.94■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 TSPYL4Q9UJ04 414 aa15.94■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 VPS37DQ86XT2 251 aa15.93■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 NINLQ9Y2I6 1382 aa15.93■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 ARID3AQ99856 593 aa15.93■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 NCOA2Q15596 1464 aa15.92■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.92■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 KIF7Q2M1P5 1343 aa15.92■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.92■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 APPP05067 770 aa15.92■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 SETQ01105 290 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.9■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 SMC3Q9UQE7 1217 aa15.9■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa15.9■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 PDE4CQ08493 712 aa15.9■□□□□ 0.14
TNS1-207ENST00000430930 NFXL1Q6ZNB6 911 aa15.89■□□□□ 0.13
TNS1-207ENST00000430930 MSH5O43196 834 aa15.89■□□□□ 0.13
TNS1-207ENST00000430930 BICD2Q8TD16 824 aa15.89■□□□□ 0.13
TNS1-207ENST00000430930 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.89■□□□□ 0.13
TNS1-207ENST00000430930 CDC45O75419 566 aa15.89■□□□□ 0.13
TNS1-207ENST00000430930 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.133e-6■□□□□ 10.7
TNS1-207ENST00000430930 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.88■□□□□ 0.13
TNS1-207ENST00000430930 ATF3P18847 181 aa15.88■□□□□ 0.13
TNS1-207ENST00000430930 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
TNS1-207ENST00000430930 SYNJ2O15056 1496 aa15.87■□□□□ 0.13
TNS1-207ENST00000430930 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
TNS1-207ENST00000430930 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.87■□□□□ 0.13
TNS1-207ENST00000430930 GRIN2BQ13224 1484 aa15.87■□□□□ 0.13
TNS1-207ENST00000430930 SASS6Q6UVJ0 657 aa15.87■□□□□ 0.13
TNS1-207ENST00000430930 SLC4A3P48751 1232 aa15.87■□□□□ 0.13
TNS1-207ENST00000430930 NECTIN2Q92692 538 aa15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms