RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
SNX11-201ENST00000359238 NOS1P29475 1434 aa25.48■■□□□ 1.67
SNX11-201ENST00000359238 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.48■■□□□ 1.67
SNX11-201ENST00000359238 CCDC184Q52MB2 194 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX11-201ENST00000359238 IFT172Q9UG01 1749 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX11-201ENST00000359238 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX11-201ENST00000359238 SYNMO15061 1565 aa25.45■■□□□ 1.66
SNX11-201ENST00000359238 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
SNX11-201ENST00000359238 LAMC1P11047 1609 aa25.45■■□□□ 1.66
SNX11-201ENST00000359238 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
SNX11-201ENST00000359238 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
SNX11-201ENST00000359238 ADGRB3O60242 1522 aa25.42■■□□□ 1.66
SNX11-201ENST00000359238 TESK2Q96S53 571 aa25.42■■□□□ 1.66
SNX11-201ENST00000359238 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.41■■□□□ 1.66
SNX11-201ENST00000359238 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SNX11-201ENST00000359238 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.39■■□□□ 1.66
SNX11-201ENST00000359238 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.38■■□□□ 1.65
SNX11-201ENST00000359238 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
SNX11-201ENST00000359238 IQGAP1P46940 1657 aa25.38■■□□□ 1.65
SNX11-201ENST00000359238 IDI1Q13907 227 aa25.38■■□□□ 1.65
SNX11-201ENST00000359238 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.38■■□□□ 1.65
SNX11-201ENST00000359238 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.38■■□□□ 1.65
SNX11-201ENST00000359238 PIK3C2BO00750 1634 aa25.36■■□□□ 1.65
SNX11-201ENST00000359238 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SNX11-201ENST00000359238 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX11-201ENST00000359238 PPLO60437 1756 aa25.34■■□□□ 1.65
SNX11-201ENST00000359238 ERVK-7P63135 1459 aa25.34■■□□□ 1.65
SNX11-201ENST00000359238 STAC3Q96MF2 364 aa25.34■■□□□ 1.65
SNX11-201ENST00000359238 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.34■■□□□ 1.65
SNX11-201ENST00000359238 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
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SNX11-201ENST00000359238 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.31■■□□□ 1.64
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SNX11-201ENST00000359238 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.28■■□□□ 1.64
SNX11-201ENST00000359238 ZMYM3Q14202 1370 aa25.27■■□□□ 1.64
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SNX11-201ENST00000359238 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX11-201ENST00000359238 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX11-201ENST00000359238 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX11-201ENST00000359238 PIK3C2GO75747 1445 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX11-201ENST00000359238 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX11-201ENST00000359238 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX11-201ENST00000359238 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.2■■□□□ 1.63
SNX11-201ENST00000359238 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.18■■□□□ 1.62
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SNX11-201ENST00000359238 TMF1P82094 1093 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX11-201ENST00000359238 MRS2Q9HD23 443 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX11-201ENST00000359238 ADGRB1O14514 1584 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX11-201ENST00000359238 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SNX11-201ENST00000359238 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SNX11-201ENST00000359238 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SNX11-201ENST00000359238 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.15■■□□□ 1.62
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SNX11-201ENST00000359238 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SNX11-201ENST00000359238 PANK3Q9H999 370 aa25.13■■□□□ 1.61
SNX11-201ENST00000359238 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.13■■□□□ 1.61
SNX11-201ENST00000359238 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.11■■□□□ 1.61
SNX11-201ENST00000359238 TNRQ92752 1358 aa25.1■■□□□ 1.61
SNX11-201ENST00000359238 MYOM1P52179 1685 aa25.1■■□□□ 1.61
SNX11-201ENST00000359238 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.1■■□□□ 1.61
SNX11-201ENST00000359238 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SNX11-201ENST00000359238 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.61
SNX11-201ENST00000359238 ZFYVE9O95405 1425 aa25.07■■□□□ 1.6
SNX11-201ENST00000359238 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.06■■□□□ 1.6
SNX11-201ENST00000359238 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.06■■□□□ 1.6
SNX11-201ENST00000359238 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.05■■□□□ 1.6
SNX11-201ENST00000359238 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SNX11-201ENST00000359238 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.05■■□□□ 1.6
SNX11-201ENST00000359238 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.05■■□□□ 1.6
SNX11-201ENST00000359238 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.03■■□□□ 1.6
SNX11-201ENST00000359238 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.03■■□□□ 1.6
SNX11-201ENST00000359238 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SNX11-201ENST00000359238 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
SNX11-201ENST00000359238 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SNX11-201ENST00000359238 C3P01024 1663 aa25.01■■□□□ 1.59
SNX11-201ENST00000359238 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
SNX11-201ENST00000359238 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.99■■□□□ 1.59
SNX11-201ENST00000359238 STK26Q9P289 416 aa24.97■■□□□ 1.59
SNX11-201ENST00000359238 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
SNX11-201ENST00000359238 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
SNX11-201ENST00000359238 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
SNX11-201ENST00000359238 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
SNX11-201ENST00000359238 RALBP1Q15311 655 aa24.93■■□□□ 1.58
SNX11-201ENST00000359238 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.93■■□□□ 1.58
SNX11-201ENST00000359238 ALKQ9UM73 1620 aa24.93■■□□□ 1.58
SNX11-201ENST00000359238 TMC1Q8TDI8 760 aa24.92■■□□□ 1.58
SNX11-201ENST00000359238 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.92■■□□□ 1.58
SNX11-201ENST00000359238 NLRP1Q9C000 1473 aa24.91■■□□□ 1.58
SNX11-201ENST00000359238 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SNX11-201ENST00000359238 CDCA8Q53HL2 280 aa24.9■■□□□ 1.58
SNX11-201ENST00000359238 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
SNX11-201ENST00000359238 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.9■■□□□ 1.58
SNX11-201ENST00000359238 PTPRMP28827 1452 aa24.9■■□□□ 1.58
SNX11-201ENST00000359238 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.9■■□□□ 1.58
SNX11-201ENST00000359238 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
SNX11-201ENST00000359238 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.58
SNX11-201ENST00000359238 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.89■■□□□ 1.58
SNX11-201ENST00000359238 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
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