RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 TET3O43151 1660 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP1-201ENST00000357436 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP1-201ENST00000357436 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP1-201ENST00000357436 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SH3BP1-201ENST00000357436 NPATQ14207 1427 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP1-201ENST00000357436 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP1-201ENST00000357436 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP1-201ENST00000357436 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SH3BP1-201ENST00000357436 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SH3BP1-201ENST00000357436 NLRP13Q86W25 1043 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP1-201ENST00000357436 NEO1Q92859 1461 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SH3BP1-201ENST00000357436 PANK3Q9H999 370 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP1-201ENST00000357436 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP1-201ENST00000357436 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP1-201ENST00000357436 TMF1P82094 1093 aa25.14■■□□□ 1.61
SH3BP1-201ENST00000357436 NOS1P29475 1434 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP1-201ENST00000357436 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BP1-201ENST00000357436 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BP1-201ENST00000357436 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.11■■□□□ 1.61
SH3BP1-201ENST00000357436 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SH3BP1-201ENST00000357436 MADDQ8WXG6 1647 aa25.11■■□□□ 1.61
SH3BP1-201ENST00000357436 IDI1Q13907 227 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP1-201ENST00000357436 DIP2BQ9P265 1576 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCC3O15438 1527 aa25.08■■□□□ 1.6
SH3BP1-201ENST00000357436 RICTORQ6R327 1708 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP1-201ENST00000357436 MROH2AA6NES4 1674 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP1-201ENST00000357436 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
SH3BP1-201ENST00000357436 IQGAP1P46940 1657 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP1-201ENST00000357436 INSRP06213 1382 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP1-201ENST00000357436 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP1-201ENST00000357436 PDE3BQ13370 1112 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP1-201ENST00000357436 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP1-201ENST00000357436 STAC3Q96MF2 364 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP1-201ENST00000357436 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25■■□□□ 1.59
SH3BP1-201ENST00000357436 STK26Q9P289 416 aa25■■□□□ 1.59
SH3BP1-201ENST00000357436 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
SH3BP1-201ENST00000357436 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
SH3BP1-201ENST00000357436 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BP1-201ENST00000357436 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SH3BP1-201ENST00000357436 KIF1BO60333 1816 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BP1-201ENST00000357436 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.97■■□□□ 1.59
SH3BP1-201ENST00000357436 GLI2P10070 1586 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP1-201ENST00000357436 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BP1-201ENST00000357436 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP1-201ENST00000357436 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP1-201ENST00000357436 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP1-201ENST00000357436 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP1-201ENST00000357436 ADGRB3O60242 1522 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP1-201ENST00000357436 SYNMO15061 1565 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP1-201ENST00000357436 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BP1-201ENST00000357436 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP1-201ENST00000357436 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SH3BP1-201ENST00000357436 CDCA8Q53HL2 280 aa24.89■■□□□ 1.57
SH3BP1-201ENST00000357436 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP1-201ENST00000357436 MYOM2P54296 1465 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP1-201ENST00000357436 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SH3BP1-201ENST00000357436 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SH3BP1-201ENST00000357436 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SH3BP1-201ENST00000357436 MYOM1P52179 1685 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP1-201ENST00000357436 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP1-201ENST00000357436 PIK3C2GO75747 1445 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP1-201ENST00000357436 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP2R1AP30153 589 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP1-201ENST00000357436 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP1-201ENST00000357436 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
SH3BP1-201ENST00000357436 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.83■■□□□ 1.56
SH3BP1-201ENST00000357436 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP1-201ENST00000357436 ERVK-7P63135 1459 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP1-201ENST00000357436 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP1-201ENST00000357436 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SH3BP1-201ENST00000357436 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SH3BP1-201ENST00000357436 IFT172Q9UG01 1749 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP1-201ENST00000357436 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP1-201ENST00000357436 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP1-201ENST00000357436 CABP2Q9NPB3 220 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP1-201ENST00000357436 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SH3BP1-201ENST00000357436 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP1-201ENST00000357436 PPLO60437 1756 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP1-201ENST00000357436 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP1-201ENST00000357436 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP1-201ENST00000357436 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SH3BP1-201ENST00000357436 BCL11AQ9H165 835 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP1-201ENST00000357436 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP1-201ENST00000357436 PIK3C2BO00750 1634 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC24A1O60721 1099 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP1-201ENST00000357436 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
SH3BP1-201ENST00000357436 ADGRB1O14514 1584 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP1-201ENST00000357436 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP1-201ENST00000357436 PRAM1Q96QH2 718 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP1-201ENST00000357436 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SH3BP1-201ENST00000357436 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP1-201ENST00000357436 PLIN1O60240 522 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF521Q96K83 1311 aa24.7■■□□□ 1.55
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