RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223864.6

PLGRKT-201, Transcript of plasminogen receptor with a C-terminal lysine, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLGRKT, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLGRKT-201ENST00000223864 SPDYE6P0CI01 402 aa26.22■■□□□ 1.79
PLGRKT-201ENST00000223864 SPDYE2Q495Y8 402 aa26.22■■□□□ 1.79
PLGRKT-201ENST00000223864 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.21■■□□□ 1.79
PLGRKT-201ENST00000223864 PIK3C2BO00750 1634 aa26.19■■□□□ 1.78
PLGRKT-201ENST00000223864 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
PLGRKT-201ENST00000223864 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
PLGRKT-201ENST00000223864 MED14O60244 1454 aa26.17■■□□□ 1.78
PLGRKT-201ENST00000223864 SYNMO15061 1565 aa26.16■■□□□ 1.78
PLGRKT-201ENST00000223864 NOS1P29475 1434 aa26.16■■□□□ 1.78
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
PLGRKT-201ENST00000223864 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.15■■□□□ 1.78
PLGRKT-201ENST00000223864 SPDYE4A6NLX3 237 aa26.15■■□□□ 1.78
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
PLGRKT-201ENST00000223864 SSUH2Q9Y2M2 353 aa26.14■■□□□ 1.78
PLGRKT-201ENST00000223864 IQGAP1P46940 1657 aa26.14■■□□□ 1.78
PLGRKT-201ENST00000223864 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PLGRKT-201ENST00000223864 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.12■■□□□ 1.77
PLGRKT-201ENST00000223864 SLIT1O75093 1534 aa26.12■■□□□ 1.77
PLGRKT-201ENST00000223864 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.11■■□□□ 1.77
PLGRKT-201ENST00000223864 IDI1Q13907 227 aa26.11■■□□□ 1.77
PLGRKT-201ENST00000223864 E9PCH4 1651 aa26.11■■□□□ 1.77
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.09■■□□□ 1.77
PLGRKT-201ENST00000223864 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.09■■□□□ 1.77
PLGRKT-201ENST00000223864 NUP155O75694 1391 aa26.08■■□□□ 1.77
PLGRKT-201ENST00000223864 FKBP8Q14318 412 aa26.08■■□□□ 1.77
PLGRKT-201ENST00000223864 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PLGRKT-201ENST00000223864 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.05■■□□□ 1.76
PLGRKT-201ENST00000223864 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.05■■□□□ 1.76
PLGRKT-201ENST00000223864 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.04■■□□□ 1.76
PLGRKT-201ENST00000223864 ADGRB3O60242 1522 aa26.04■■□□□ 1.76
PLGRKT-201ENST00000223864 NAIPQ13075 1403 aa26.04■■□□□ 1.76
PLGRKT-201ENST00000223864 LTKP29376 864 aa26.03■■□□□ 1.76
PLGRKT-201ENST00000223864 EID1Q9Y6B2 187 aa26.03■■□□□ 1.76
PLGRKT-201ENST00000223864 CPS1P31327 1500 aa26.02■■□□□ 1.76
PLGRKT-201ENST00000223864 AKT1S1Q96B36 256 aa26■■□□□ 1.75
PLGRKT-201ENST00000223864 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.98■■□□□ 1.75
PLGRKT-201ENST00000223864 HFM1A2PYH4 1435 aa25.97■■□□□ 1.75
PLGRKT-201ENST00000223864 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.97■■□□□ 1.75
PLGRKT-201ENST00000223864 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.94■■□□□ 1.74
PLGRKT-201ENST00000223864 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PLGRKT-201ENST00000223864 ZFYVE9O95405 1425 aa25.88■■□□□ 1.73
PLGRKT-201ENST00000223864 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.87■■□□□ 1.73
PLGRKT-201ENST00000223864 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
PLGRKT-201ENST00000223864 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
PLGRKT-201ENST00000223864 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.86■■□□□ 1.73
PLGRKT-201ENST00000223864 TRIM52Q96A61 297 aa25.84■■□□□ 1.73
PLGRKT-201ENST00000223864 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.83■■□□□ 1.73
PLGRKT-201ENST00000223864 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.81■■□□□ 1.72
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.81■■□□□ 1.72
PLGRKT-201ENST00000223864 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.81■■□□□ 1.72
PLGRKT-201ENST00000223864 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
PLGRKT-201ENST00000223864 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
PLGRKT-201ENST00000223864 TRPM2O94759 1503 aa25.79■■□□□ 1.72
PLGRKT-201ENST00000223864 PROM2Q8N271 834 aa25.79■■□□□ 1.72
PLGRKT-201ENST00000223864 BCANQ96GW7 911 aa25.79■■□□□ 1.72
PLGRKT-201ENST00000223864 KIF1BO60333 1816 aa25.79■■□□□ 1.72
PLGRKT-201ENST00000223864 TOM1O60784 492 aa25.78■■□□□ 1.72
PLGRKT-201ENST00000223864 CLTCL1P53675 1640 aa25.77■■□□□ 1.72
PLGRKT-201ENST00000223864 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
PLGRKT-201ENST00000223864 KCNA6P17658 529 aa25.75■■□□□ 1.71
PLGRKT-201ENST00000223864 NWD1Q149M9 1564 aa25.73■■□□□ 1.71
PLGRKT-201ENST00000223864 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
PLGRKT-201ENST00000223864 ALKQ9UM73 1620 aa25.71■■□□□ 1.71
PLGRKT-201ENST00000223864 TBX22Q9Y458 520 aa25.71■■□□□ 1.71
PLGRKT-201ENST00000223864 DIP2AQ14689 1571 aa25.69■■□□□ 1.7
PLGRKT-201ENST00000223864 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
PLGRKT-201ENST00000223864 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
PLGRKT-201ENST00000223864 PIP4K2BP78356 416 aa25.68■■□□□ 1.7
PLGRKT-201ENST00000223864 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.68■■□□□ 1.7
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
PLGRKT-201ENST00000223864 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.66■■□□□ 1.7
PLGRKT-201ENST00000223864 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
PLGRKT-201ENST00000223864 TMEM94Q12767 1356 aa25.65■■□□□ 1.7
PLGRKT-201ENST00000223864 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.63■■□□□ 1.69
PLGRKT-201ENST00000223864 PITPNM1O00562 1244 aa25.63■■□□□ 1.69
PLGRKT-201ENST00000223864 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.63■■□□□ 1.69
PLGRKT-201ENST00000223864 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.63■■□□□ 1.69
PLGRKT-201ENST00000223864 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.62■■□□□ 1.69
PLGRKT-201ENST00000223864 PIK3R4Q99570 1358 aa25.62■■□□□ 1.69
PLGRKT-201ENST00000223864 HSPA1LP34931 641 aa25.57■■□□□ 1.68
PLGRKT-201ENST00000223864 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
PLGRKT-201ENST00000223864 PPLO60437 1756 aa25.56■■□□□ 1.68
PLGRKT-201ENST00000223864 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.56■■□□□ 1.68
PLGRKT-201ENST00000223864 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.54■■□□□ 1.68
PLGRKT-201ENST00000223864 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.54■■□□□ 1.68
PLGRKT-201ENST00000223864 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PLGRKT-201ENST00000223864 MSH6P52701 1360 aa25.52■■□□□ 1.68
PLGRKT-201ENST00000223864 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.52■■□□□ 1.68
PLGRKT-201ENST00000223864 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.51■■□□□ 1.67
PLGRKT-201ENST00000223864 PTPRUQ92729 1446 aa25.51■■□□□ 1.67
PLGRKT-201ENST00000223864 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.47■■□□□ 1.67
PLGRKT-201ENST00000223864 METP08581 1390 aa25.47■■□□□ 1.67
PLGRKT-201ENST00000223864 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PLGRKT-201ENST00000223864 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.46■■□□□ 1.67
PLGRKT-201ENST00000223864 IFT172Q9UG01 1749 aa25.46■■□□□ 1.67
PLGRKT-201ENST00000223864 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PLGRKT-201ENST00000223864 CLEC11AQ9Y240 323 aa25.46■■□□□ 1.67
PLGRKT-201ENST00000223864 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PLGRKT-201ENST00000223864 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms