RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 CCDC184Q52MB2 194 aa25.07■■□□□ 1.6
USP18-201ENST00000215794 C3P01024 1663 aa25.06■■□□□ 1.6
USP18-201ENST00000215794 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.06■■□□□ 1.6
USP18-201ENST00000215794 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
USP18-201ENST00000215794 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.05■■□□□ 1.6
USP18-201ENST00000215794 IDI1Q13907 227 aa25.04■■□□□ 1.6
USP18-201ENST00000215794 MROH2AA6NES4 1674 aa25.04■■□□□ 1.6
USP18-201ENST00000215794 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
USP18-201ENST00000215794 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.03■■□□□ 1.6
USP18-201ENST00000215794 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.01■■□□□ 1.59
USP18-201ENST00000215794 PIK3C2BO00750 1634 aa25■■□□□ 1.59
USP18-201ENST00000215794 KIF1BO60333 1816 aa25■■□□□ 1.59
USP18-201ENST00000215794 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.99■■□□□ 1.59
USP18-201ENST00000215794 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.96■■□□□ 1.59
USP18-201ENST00000215794 TNRQ92752 1358 aa24.96■■□□□ 1.59
USP18-201ENST00000215794 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
USP18-201ENST00000215794 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.58
USP18-201ENST00000215794 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
USP18-201ENST00000215794 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
USP18-201ENST00000215794 ADGRB3O60242 1522 aa24.94■■□□□ 1.58
USP18-201ENST00000215794 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.94■■□□□ 1.58
USP18-201ENST00000215794 MRS2Q9HD23 443 aa24.92■■□□□ 1.58
USP18-201ENST00000215794 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.91■■□□□ 1.58
USP18-201ENST00000215794 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.91■■□□□ 1.58
USP18-201ENST00000215794 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.89■■□□□ 1.58
USP18-201ENST00000215794 LAMC1P11047 1609 aa24.88■■□□□ 1.57
USP18-201ENST00000215794 PTPRMP28827 1452 aa24.88■■□□□ 1.57
USP18-201ENST00000215794 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.88■■□□□ 1.57
USP18-201ENST00000215794 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.88■■□□□ 1.57
USP18-201ENST00000215794 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.83■■□□□ 1.57
USP18-201ENST00000215794 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.83■■□□□ 1.57
USP18-201ENST00000215794 IFT172Q9UG01 1749 aa24.82■■□□□ 1.56
USP18-201ENST00000215794 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.82■■□□□ 1.56
USP18-201ENST00000215794 PPLO60437 1756 aa24.81■■□□□ 1.56
USP18-201ENST00000215794 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.81■■□□□ 1.56
USP18-201ENST00000215794 FKBP8Q14318 412 aa24.8■■□□□ 1.56
USP18-201ENST00000215794 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.8■■□□□ 1.56
USP18-201ENST00000215794 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.79■■□□□ 1.56
USP18-201ENST00000215794 TESK2Q96S53 571 aa24.78■■□□□ 1.56
USP18-201ENST00000215794 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.77■■□□□ 1.56
USP18-201ENST00000215794 NLRP1Q9C000 1473 aa24.77■■□□□ 1.56
USP18-201ENST00000215794 BCANQ96GW7 911 aa24.76■■□□□ 1.55
USP18-201ENST00000215794 MYOM2P54296 1465 aa24.72■■□□□ 1.55
USP18-201ENST00000215794 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
USP18-201ENST00000215794 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.72■■□□□ 1.55
USP18-201ENST00000215794 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.71■■□□□ 1.55
USP18-201ENST00000215794 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.71■■□□□ 1.55
USP18-201ENST00000215794 IQGAP1P46940 1657 aa24.7■■□□□ 1.55
USP18-201ENST00000215794 ZFYVE9O95405 1425 aa24.68■■□□□ 1.54
USP18-201ENST00000215794 NEFLP07196 543 aa24.68■■□□□ 1.54
USP18-201ENST00000215794 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.68■■□□□ 1.54
USP18-201ENST00000215794 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
USP18-201ENST00000215794 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.67■■□□□ 1.54
USP18-201ENST00000215794 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
USP18-201ENST00000215794 PIK3C2GO75747 1445 aa24.67■■□□□ 1.54
USP18-201ENST00000215794 LTKP29376 864 aa24.67■■□□□ 1.54
USP18-201ENST00000215794 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.66■■□□□ 1.54
USP18-201ENST00000215794 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
USP18-201ENST00000215794 TMF1P82094 1093 aa24.65■■□□□ 1.54
USP18-201ENST00000215794 STAC3Q96MF2 364 aa24.64■■□□□ 1.53
USP18-201ENST00000215794 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
USP18-201ENST00000215794 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
USP18-201ENST00000215794 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.63■■□□□ 1.53
USP18-201ENST00000215794 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
USP18-201ENST00000215794 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
USP18-201ENST00000215794 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.62■■□□□ 1.53
USP18-201ENST00000215794 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
USP18-201ENST00000215794 RALBP1Q15311 655 aa24.61■■□□□ 1.53
USP18-201ENST00000215794 TMC1Q8TDI8 760 aa24.61■■□□□ 1.53
USP18-201ENST00000215794 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
USP18-201ENST00000215794 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
USP18-201ENST00000215794 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.59■■□□□ 1.53
USP18-201ENST00000215794 PANK3Q9H999 370 aa24.59■■□□□ 1.53
USP18-201ENST00000215794 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.58■■□□□ 1.53
USP18-201ENST00000215794 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
USP18-201ENST00000215794 SLIT1O75093 1534 aa24.58■■□□□ 1.52
USP18-201ENST00000215794 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.57■■□□□ 1.52
USP18-201ENST00000215794 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.57■■□□□ 1.52
USP18-201ENST00000215794 HSPA2P54652 639 aa24.56■■□□□ 1.52
USP18-201ENST00000215794 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
USP18-201ENST00000215794 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.52
USP18-201ENST00000215794 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.56■■□□□ 1.52
USP18-201ENST00000215794 EID1Q9Y6B2 187 aa24.55■■□□□ 1.52
USP18-201ENST00000215794 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
USP18-201ENST00000215794 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
USP18-201ENST00000215794 ALKQ9UM73 1620 aa24.54■■□□□ 1.52
USP18-201ENST00000215794 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.54■■□□□ 1.52
USP18-201ENST00000215794 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.53■■□□□ 1.52
USP18-201ENST00000215794 ADGRB1O14514 1584 aa24.52■■□□□ 1.52
USP18-201ENST00000215794 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
USP18-201ENST00000215794 STK26Q9P289 416 aa24.52■■□□□ 1.52
USP18-201ENST00000215794 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
USP18-201ENST00000215794 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.5■■□□□ 1.51
USP18-201ENST00000215794 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.49■■□□□ 1.51
USP18-201ENST00000215794 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
USP18-201ENST00000215794 NLRP13Q86W25 1043 aa24.49■■□□□ 1.51
USP18-201ENST00000215794 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
USP18-201ENST00000215794 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.48■■□□□ 1.51
USP18-201ENST00000215794 METP08581 1390 aa24.47■■□□□ 1.51
USP18-201ENST00000215794 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.9 ms