RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101395.2

Hoxa4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa4, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa40.64■■■■■ 4.1
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mroh1E0CZ22 1640 aa40.61■■■■■ 4.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rims1Q99NE5 1463 aa40.58■■■■■ 4.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa40.57■■■■■ 4.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Alpk3Q924C5 1678 aa40.54■■■■■ 4.08
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rundc1Q0VDN7 615 aa40.53■■■■■ 4.08
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP40.5■■■■■ 4.07
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Card11Q8CIS0 1159 aa40.49■■■■■ 4.07
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa40.49■■■■■ 4.07
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa40.45■■■■■ 4.07
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa40.41■■■■■ 4.06
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa40.41■■■■■ 4.06
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Naip7Q9JIB3 1402 aa40.39■■■■■ 4.06
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dip2bQ3UH60 1574 aa40.39■■■■■ 4.06
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PtprmP28828 1452 aa40.38■■■■■ 4.05
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sall2Q9QX96 1004 aa40.36■■■■■ 4.05
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kif13aQ9EQW7 1749 aa40.36■■■■■ 4.05
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 AU022751B1B0V2 589 aa40.35■■■■■ 4.05
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Bcl9Q9D219 1425 aa40.34■■■■■ 4.05
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kdm2aP59997 1161 aa40.33■■■■■ 4.05
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc52a2Q9D8F3 450 aa40.32■■■■■ 4.05
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Myo3aQ8K3H5 1613 aa40.31■■■■■ 4.04
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm20521D3Z5F7 333 aa40.3■■■■■ 4.04
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ncoa1P70365 1447 aa40.29■■■■■ 4.04
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Stard8Q8K031 1019 aa40.28■■■■■ 4.04
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rock2P70336 1388 aa40.28■■■■■ 4.04
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Os9Q8K2C7 672 aa40.26■■■■■ 4.04
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa40.19■■■■■ 4.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fan1Q69ZT1 1020 aa40.18■■■■■ 4.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 MyclP10166 368 aa40.17■■■■■ 4.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa40.15■■■■■ 4.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pcgf6Q99NA9 353 aa40.14■■■■■ 4.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Srcin1Q9QWI6 1250 aa40.12■■■■■ 4.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nphp4P59240 1425 aa40.12■■■■■ 4.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PplQ9R269 1755 aa40.1■■■■■ 4.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Setd1aE9PYH6 1716 aa40.09■■■■■ 4.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa40.09■■■■■ 4.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 DnmbpQ6TXD4 1580 aa40.07■■■■■ 4.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Plekhg5Q66T02 1073 aa40.06■■■■■ 4
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Txndc2Q6P902 515 aa40.06■■■■■ 4
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Arhgef28P97433 1693 aa40.04■■■■■ 4
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pola1P33609 1465 aa40.03■■■■■ 4
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa40.02■■■■■ 4
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lrrc7Q80TE7 1490 aa40.02■■■■■ 4
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa40.02■■■■■ 4
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Shq1Q7TMX5 569 aa40.01■■■■■ 4
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Psme1P97371 249 aa40.01■■■■□ 3.99
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 P3h3Q8CG70 732 aa40.01■■■■□ 3.99
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atp1b4Q99ME6 356 aa40.01■■■■□ 3.99
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PalldQ9ET54 1408 aa40■■■■□ 3.99
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 MaddQ80U28 1577 aa39.99■■■■□ 3.99
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa39.97■■■■□ 3.99
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dip2aQ8BWT5 1523 aa39.97■■■■□ 3.99
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 IqubQ8CDK3 788 aa39.94■■■■□ 3.98
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Q9D9H8 365 aa39.9■■■■□ 3.98
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Topaz1E5FYH1 1653 aa39.9■■■■□ 3.98
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm13695A2AK44 830 aa39.87■■■■□ 3.97
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slit3Q9WVB4 1523 aa39.85■■■■□ 3.97
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa39.84■■■■□ 3.97
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ift172Q6VH22 1749 aa39.84■■■■□ 3.97
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Stag3O70576 1240 aa39.83■■■■□ 3.97
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Plekhg1F6S200 1446 aa39.82■■■■□ 3.97
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zbtb4Q5F293 982 aa39.77■■■■□ 3.96
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PzpQ61838 1495 aa39.76■■■■□ 3.96
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sbno1Q689Z5 1390 aa39.75■■■■□ 3.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pik3r4Q8VD65 1358 aa39.75■■■■□ 3.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Stk26Q99JT2 416 aa39.72■■■■□ 3.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa39.71■■■■□ 3.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 CenpjQ569L8 1344 aa39.7■■■■□ 3.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa39.69■■■■□ 3.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 IghaA0A0A6YXW6 389 aa39.66■■■■□ 3.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Asxl2Q8BZ32 1370 aa39.66■■■■□ 3.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa39.65■■■■□ 3.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Arap3Q8R5G7 1538 aa39.65■■■■□ 3.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Brwd3A2AHJ4 1799 aa39.63■■■■□ 3.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 InsrP15208 1372 aa39.62■■■■□ 3.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cep170bQ80U49 1574 aa39.61■■■■□ 3.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP39.61■■■■□ 3.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc24a1Q91WD8 1130 aa39.59■■■■□ 3.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cps1Q8C196 1500 aa39.58■■■■□ 3.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rims2Q9EQZ7 1530 aa39.55■■■■□ 3.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP39.54■■■■□ 3.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tmf1B9EKI3 1091 aa39.54■■■■□ 3.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa39.53■■■■□ 3.92
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