RNA–Protein interactions for RNA: YPR094W

RDS3, Transcript of Component of the SF3b subcomplex of the U2 snRNP, yeastyeast

Gene RDS3, Length 324 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3YPR094W ERD2P18414 219 aa-0.88□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W DDR48P18899 430 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W YSR3P23501 404 aa-0.88□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W VPS3P23643 1011 aa-0.88□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W SLM6P38343 150 aa-0.88□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W GOS1P38736 223 aa-0.88□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W DOG2P38773 246 aa-0.88□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W IRC22P40006 225 aa-0.88□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W GVP36P40531 326 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W SWP1Q02795 286 aa-0.88□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W YDR248CQ03786 193 aa-0.88□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W UPS3Q04006 179 aa-0.88□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W CUR1Q06469 252 aa-0.88□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W FYV12Q08559 129 aa-0.88□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W ABP140Q08641 628 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W FIT2Q08906 153 aa-0.88□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W TAR1Q8TGM6 124 aa-0.88□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W TIM9O74700 87 aa-0.89□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W CDC10P25342 322 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W YJR015WP47090 510 aa-0.89□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W SNZ1Q03148 297 aa-0.89□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W YML096WQ04489 525 aa-0.89□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W MSF1P08425 469 aa-0.9□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W YBR285WP38354 144 aa-0.9□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W SMB1P40018 196 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W ABF2Q02486 183 aa-0.9□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W VPS71Q03433 280 aa-0.9□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W ELP6Q04868 273 aa-0.9□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W UPS1Q05776 175 aa-0.9□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W BCP1Q06338 283 aa-0.9□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W TSC3Q3E790 80 aa-0.9□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W YFR032C-BQ8TGU2 87 aa-0.9□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W TEL1P38110 2787 aa-0.9□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W MET16P18408 261 aaPredicted RBP-0.91□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W SGE1P33335 543 aa-0.91□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W MRPL28P36527 147 aa-0.91□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W RIB1P38066 345 aa-0.91□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W DDI1P40087 428 aa-0.91□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W YMR141CP40211 102 aa-0.91□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W COA1P40452 197 aa-0.91□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W FMP33P46998 180 aa-0.91□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W NUP84P52891 726 aa-0.91□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W DAD4P69851 72 aa-0.91□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W LPP1Q04396 274 aa-0.91□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W YPR098CQ06089 161 aa-0.91□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W YLR413WQ06689 675 aa-0.91□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W HIS1P00498 297 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W COX8P04039 78 aa-0.92□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W ATG22P25568 528 aa-0.92□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W MAK5P38112 773 aaPredicted RBP-0.92□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W ILM1P47155 203 aa-0.92□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W MPC3P53311 146 aa-0.92□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W YNL260CP53846 198 aa-0.92□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W YDC1Q02896 317 aa-0.92□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W OST6Q03723 332 aa-0.92□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W URA2P07259 2214 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W HOM6P31116 359 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W MGM101P32787 269 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W SWE1P32944 819 aa-0.93□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W SKG1P36169 355 aa-0.93□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W POP4P38336 279 aa-0.93□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W TVP23P38962 199 aa-0.93□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W MOB1P40484 314 aa-0.93□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W LOC1P43586 204 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W YDR274CP87283 123 aa-0.93□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W SPO19Q03029 223 aa-0.93□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W SEN15Q04675 128 aa-0.93□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W RNH202Q05635 350 aa-0.93□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W SEI1Q06058 285 aa-0.93□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W KEI1Q06346 221 aa-0.93□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W MCP1Q12106 302 aa-0.93□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W JLP1Q12358 412 aa-0.93□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W NUM1Q00402 2748 aa-0.93□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W MEK1P24719 497 aaPredicted RBP-0.94□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W UBC6P33296 250 aaPredicted RBP-0.94□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W PRS2P38620 318 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W YHR127WP38833 243 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W ERG28P40030 148 aa-0.94□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W MRX5P47007 382 aa-0.94□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W THG1P53215 237 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W PRO2P54885 456 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W DID2P69771 204 aa-0.94□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.94□□□□□ -2.56not detected
RDS3YPR094W YMD8Q03697 442 aa-0.94□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W RNH1Q04740 348 aa-0.94□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP-0.94□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W ROM2P51862 1356 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W YDR157WA0A023PZE8 133 aa-0.95□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W GCD2P12754 651 aaPredicted RBP-0.95□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W SEC17P32602 292 aa-0.95□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W PAN3P36102 679 aaPredicted RBP-0.95□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W YKR070WP36151 352 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W ALB1P47019 175 aaPredicted RBP-0.95□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W UBC12P52491 188 aa-0.95□□□□□ -2.56
RDS3YPR094W PNC1P53184 216 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
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