RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	YML003W	P0CF16	290 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	ERG3	P32353	365 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	SUA5	P32579	426 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	RRF1	P38771	230 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	DIE2	P50076	525 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YDR248C	Q03786	193 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	ECM18	Q04623	453 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YDR286C	Q05530	114 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YOR186W	Q08560	144 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	SCP1	Q08873	200 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	FIT3	Q08907	204 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	ATX2	Q12067	313 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	SPO24	Q3E752	67 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	SAG1	P20840	650 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	FMT1	P32785	401 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YKL063C	P35725	167 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	PAM16	P42949	149 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	ECM27	P47144	725 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	UFD1	P53044	361 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YNL046W	P53956	172 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	MRP51	Q02950	344 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	GMC1	Q04399	608 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	LIP2	Q06005	328 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YLR352W	Q06479	807 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	VAM3	Q12241	283 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	MED4	Q12343	284 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	DGK1	Q12382	290 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	ERP4	Q12450	207 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	PET122	P10355	254 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	HNM1	P19807	563 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	ATG15	P25641	520 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YBL010C	P32788	280 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	MRPS5	P33759	307 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YUH1	P35127	236 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YBR220C	P38318	560 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	MTC6	P38849	526 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YND1	P40009	630 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YIL060W	P40519	144 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	OTU1	P43558	301 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	GWT1	P47026	490 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	XPT1	P47165	209 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	SOL1	P50278	321 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	UBC13	P52490	153 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YGR042W	P53227	271 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YML018C	Q03730	393 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	API2	Q04413	109 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	SYM1	Q06563	197 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	HEM25	Q07534	307 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YNG1	Q08465	219 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	SRL1	Q08673	210 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	ATG40	Q99325	256 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	ACB1	P31787	87 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	ACP1	P32463	125 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	SRY1	P36007	326 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	SNX4	P47057	423 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	NIF3	P53081	288 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	MEH1	Q02205	184 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	CAB5	Q03941	241 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	RTR2	Q12378	196 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	HUT1	Q12520	339 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	UBA3	Q99344	299 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	QCR2	P07257	368 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	CKA1	P15790	372 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	APA2	P22108	325 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	MRP20	P32387	263 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YOX1	P34161	385 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	CPR5	P35176	225 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	POP2	P39008	433 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	FLX1	P40464	311 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	SRB7	P47822	140 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	PHB2	P50085	310 aa		3.85	□□□□□ -1.79

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