RNA–Protein interactions for RNA: YOL056W

GPM3, Transcript of Homolog of Gpm1p phosphoglycerate mutase, yeast

Gene GPM3, Length 912 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GPM3	YOL056W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	COX5B	P00425	151 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	SGA1	P08019	549 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	HNM1	P19807	563 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	NAT2	P37293	288 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YGR210C	P42942	411 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	JAC1	P53193	184 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
GPM3	YOL056W	CAB5	Q03941	241 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	MED4	Q12343	284 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	ERP4	Q12450	207 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	FLO9	P39712	1322 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	AAC1	P04710	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	FMT1	P32785	401 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	MRPL36	P36531	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	BMT5	P40493	336 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	SRB7	P47822	140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	DID2	P69771	204 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	RAF1	Q06891	181 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	ISN1	Q99312	450 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	UBA3	Q99344	299 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	GAL1	P04385	528 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YCR061W	P25639	631 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	VAM7	P32912	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	POP8	P38208	133 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	COS8	P38723	381 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YND1	P40009	630 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	SLM1	P40485	686 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YIL029C	P40538	142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	NIF3	P53081	288 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	RPN14	P53196	417 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	MEH1	Q02205	184 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	MRP51	Q02950	344 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	RCE1	Q03530	315 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	HOF1	Q05080	669 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YPR098C	Q06089	161 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	SYM1	Q06563	197 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	AEP3	Q12089	606 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	FMP16	Q12497	93 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	CKA1	P15790	372 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	MRP20	P32387	263 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	ECM25	P32525	599 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	REC114	P32841	428 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	MCH2	P36032	473 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	GEP4	P38812	185 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	YIL169C	P40442	995 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	XBP1	P40489	647 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	SSN8	P47821	323 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	UBC12	P52491	188 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	UBC11	P52492	156 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	SUR7	P54003	302 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	RTT103	Q05543	409 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	ANT1	Q06497	328 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	QCR2	P07257	368 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	PEX4	P29340	183 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	MTC7	P32633	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	PDC2	P32896	925 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	YEL057C	P39983	233 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	YIR035C	P40579	254 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	UFD1	P53044	361 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	OKP1	P53298	406 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	YPL067C	Q02754	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPM3	YOL056W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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