RNA–Protein interactions for RNA: YMR314W

PRE5, Transcript of Alpha 6 subunit of the 20S proteasome, yeast

Gene PRE5, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRE5	YMR314W	MPC2	P38857	129 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	AVT6	P40074	448 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	SKP1	P52286	194 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	IMO32	P53219	342 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	PAU12	P53343	120 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	TDA1	Q03533	586 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	MCH1	Q07376	486 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	HEM25	Q07534	307 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	TFC7	Q12415	435 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	YPR1	Q12458	312 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	HYM1	P32464	399 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	YBR285W	P38354	144 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	FIT1	Q04433	528 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	YLR345W	Q06137	509 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	YLR346C	Q06139	101 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	DGK1	Q12382	290 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	SWD3	P38123	315 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	UMP1	P38293	148 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	YHK8	P38776	514 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	ERG25	P53045	309 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	NDE2	Q07500	545 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	MRS3	P10566	314 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	FUN26	P31381	517 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	GWT1	P47026	490 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.73	□□□□□ -1.49	not detected
PRE5	YMR314W	HLR1	Q04429	423 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	ATG17	Q06410	417 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	TDA6	Q06466	467 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	PAU24	P38155	120 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	PRM5	P40476	318 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	FMC1	P40491	155 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	SOL1	P50278	321 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	YMR252C	Q04814	134 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	YOS1	Q3E834	85 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PRE5	YMR314W	PDC2	P32896	925 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	SRL3	P36167	246 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	COX15	P40086	486 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	YNL194C	P40169	301 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	RFC2	P40348	353 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	YRB2	P40517	327 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	ASI2	P53895	289 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	ASR1	Q06834	288 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	YPL199C	Q08954	240 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	ERG3	P32353	365 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	YBL010C	P32788	280 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	REC104	P33323	182 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	SRY1	P36007	326 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	BMT5	P40493	336 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	YFR035C	P43608	114 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	YJL163C	P46996	555 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	YJR120W	P47157	116 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	ROX3	P25046	220 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	LSB5	P25369	354 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	SFK1	P35735	353 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	YGR210C	P42942	411 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	YJR012C	P47087	207 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	CRH1	P53301	507 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	LPP1	Q04396	274 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	YOL118C	Q08259	102 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	GAL1	P04385	528 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	ATR1	P13090	542 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	CKA1	P15790	372 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	PET18	P25362	215 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	OCH1	P31755	480 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	PAU2	P32612	120 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	IKI1	P38874	309 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	SNL1	P40548	159 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	GRX5	Q02784	150 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	AEP3	Q12089	606 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	MRP20	P32387	263 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	VAM7	P32912	316 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	YKR045C	P36138	183 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	GEP4	P38812	185 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PRE5	YMR314W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5

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