RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W RAD51P25454 400 aa3.32□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W YGP1P38616 354 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W COS8P38723 381 aa3.32□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W MMS2P53152 137 aa3.32□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W GTR2P53290 341 aa3.32□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W YOR020W-AQ3E824 90 aa3.32□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W QCR6P00127 147 aa3.31□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W YPT52P36018 234 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W SEC72P39742 193 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W PRM8P53174 237 aa3.31□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W DIA1P54005 336 aa3.31□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W ABF2Q02486 183 aa3.31□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W YMD8Q03697 442 aa3.31□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W GRH1Q04410 372 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W YDR114CQ04597 100 aa3.31□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W NIP7Q08962 181 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W AGC1Q12482 902 aa3.31□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W FCY2P17064 533 aa3.3□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W DOG2P38773 246 aa3.3□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W DOG1P38774 246 aa3.3□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W RPF1P38805 295 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W EGD2P38879 174 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W FIS1P40515 155 aa3.3□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W GON7P46984 123 aa3.3□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W YJL016WP47072 561 aa3.3□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W RSM10Q03201 203 aa3.3□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W YMR279CQ03263 540 aa3.3□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W IES4Q08561 116 aa3.3□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W MRPL28P36527 147 aa3.29□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W YAR068WP39564 161 aa3.29□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W OST2P46964 130 aa3.29□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W CCH1P50077 2039 aa3.29□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W AGA2P32781 87 aa3.28□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W YBR063CP38083 404 aa3.28□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W RPA43P46669 326 aa3.28□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W YJR056CP47115 236 aa3.28□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W DID2P69771 204 aa3.28□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W GRE1Q08969 168 aa3.28□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W MDM32Q12171 622 aa3.28□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W ADH3P07246 375 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W SEC4P07560 215 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W KSS1P14681 368 aa3.27□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W RME1P32338 300 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W FMT1P32785 401 aa3.27□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W ECM33P38248 429 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W PET191Q02772 108 aa3.27□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W GIM5Q04493 163 aa3.27□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W YNG1Q08465 219 aa3.27□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W YOR268CQ08734 132 aa3.27□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W CMC2Q3E7A4 109 aa3.27□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W YPR170W-BP0C5R9 85 aa3.26□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W ECM4P36156 370 aa3.26□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W YHR125WP38831 101 aa3.26□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W RMD6P39975 231 aa3.26□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W COG3P40094 801 aa3.26□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data3.26□□□□□ -1.89not detected
YKR047WYKR047W ERG10P41338 398 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W PIR5P46999 287 aa3.26□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W LSM7P53905 115 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W ATG39Q06159 398 aa3.26□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W YPR195CQ06594 109 aa3.26□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W YDL012CQ12489 107 aa3.26□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W TDA8Q6B2U8 126 aa3.26□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W YHR214C-EQ8TGK0 99 aa3.26□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W SAS5Q99314 248 aa3.26□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W FKS1P38631 1876 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W SNF6P18888 332 aa3.25□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W TCA17P32613 152 aa3.25□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W PTM1P32857 523 aa3.25□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W CAF4P36130 643 aa3.25□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W AIM25P47140 327 aa3.25□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W LPP1Q04396 274 aa3.25□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W RPL25P04456 142 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W FBA1P14540 359 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W YKR032WP36127 104 aa3.24□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W SHG1P38337 142 aa3.24□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W IRC22P40006 225 aa3.24□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W YER084WP40057 128 aa3.24□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W GAS3Q03655 524 aa3.24□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W FEX1Q08913 375 aa3.24□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W FEX2Q08991 375 aa3.24□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W USB1Q12208 290 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W Q0255P03881 472 aa3.23□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W CDC7P06243 507 aa3.23□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W ATG22P25568 528 aa3.23□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W ARC19P33204 171 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W YER188WP40103 239 aa3.23□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W POG1P40473 351 aa3.23□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W SSU72P53538 206 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W PEX12Q04370 399 aa3.23□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W SMD2Q06217 110 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W YET3Q07451 203 aa3.23□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W YOL160WQ08321 113 aa3.23□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W MRS1P07266 363 aa3.22□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W YHR032W-AP0C5N6 59 aa3.22□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W KRE1P17260 313 aa3.22□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W TIF34P40217 347 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W YGR050CP53231 118 aa3.22□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W YNL010WP53981 241 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 54.8 ms