RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CYK3	YDL117W	SPT23	P35210	1082 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	UME6	P39001	836 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	CTR1	P49573	406 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	YGR015C	P53208	328 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	FRE4	P53746	719 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	TSA2	Q04120	196 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	PFA4	Q12006	378 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	UBR1	P19812	1950 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	RIP1	P08067	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	MRP17	P28778	131 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	NTH1	P32356	751 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	MRP20	P32387	263 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	PEX2	P32800	271 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	SFC1	P33303	322 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	AYR1	P40471	297 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	SDP1	P40479	209 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	PAU15	P40585	124 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	POP1	P41812	875 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	COX18	P53239	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	YHM2	Q04013	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	THI74	Q04083	370 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
CYK3	YDL117W	SCO1	P23833	295 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	FRM2	P37261	193 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	TRS20	P38334	175 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	SPR6	Q01684	191 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	MCT1	Q12283	360 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	STE7	P06784	515 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	GPI12	P23797	304 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	NFS1	P25374	497 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	SYN8	P31377	255 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	YHR210C	P38893	341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	PEP8	P40335	379 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	EFM6	P53970	246 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	AVO2	Q04749	426 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	INM2	Q05533	292 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	LIP2	Q06005	328 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	INO4	P13902	151 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	MSN2	P33748	704 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	MEP2	P41948	499 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	CIN2	P46670	268 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	GCV1	P48015	400 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	COQ5	P49017	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	HEM25	Q07534	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	CDC21	P06785	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	FCY2	P17064	533 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	YPS6	P40583	537 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	SDT1	P53078	280 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	DCI1	Q08558	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	MCP1	Q12106	302 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	FRE7	Q12333	620 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	ORT1	Q12375	292 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	POX1	P13711	748 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	MRPL6	P32904	214 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	TKL2	P33315	681 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	APJ1	P53940	528 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	LOA1	Q06508	300 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	YMR31	P19955	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	INO2	P26798	304 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	MSS51	P32335	436 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	SGE1	P33335	543 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	THI80	P35202	319 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	YBR090C	P38253	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	PHO89	P38361	574 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	GAA1	P39012	614 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	PEX7	P39108	375 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	XPT1	P47165	209 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	MSY1	P48527	492 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	ALG13	P53178	202 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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