RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeastyeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RNQ1YCL028W PRS2P38620 318 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W OKP1P53298 406 aa9.51□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W SED1Q01589 338 aa9.51□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W GRC3Q07845 632 aa9.51□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W UBA3Q99344 299 aa9.51□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W ARG80P07249 177 aa9.5□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W OCH1P31755 480 aa9.5□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W UTP30P36144 274 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W LNP1P38878 278 aa9.5□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W CCS1P40202 249 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W YPL067CQ02754 198 aa9.5□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W SCP1Q08873 200 aa9.5□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W ATG40Q99325 256 aa9.5□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W YML003WP0CF16 290 aa9.49□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W DAL80P26343 269 aa9.49□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W SPC29P33419 253 aa9.49□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W POP8P38208 133 aa9.49□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W COS8P38723 381 aa9.49□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W RRF1P38771 230 aa9.49□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W HNT2P49775 206 aa9.49□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W MED4Q12343 284 aa9.49□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W WHI5Q12416 295 aa9.49□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W PRM4Q12498 284 aa9.49□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W YCR016WP25617 290 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W CDC39P25655 2108 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W YOX1P34161 385 aa9.48□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W SHM2P37291 469 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W SWD3P38123 315 aa9.48□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W ECM14P38836 430 aa9.48□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W YER121WP40076 114 aa9.48□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W QRI1P43123 477 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W SLX9P53251 210 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W SMX3P54999 86 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W CAB5Q03941 241 aa9.48□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W YDR114CQ04597 100 aa9.48□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W UPS1Q05776 175 aa9.48□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W YLR108CQ12259 485 aa9.48□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W GAL1P04385 528 aa9.47□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W RPL39P04650 51 aa9.47□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W CKA1P15790 372 aa9.47□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W SEN2P16658 377 aa9.47□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W YKL187CP34231 750 aa9.47□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W RMD6P39975 231 aa9.47□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W YGR210CP42942 411 aa9.47□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W FRE8Q12209 686 aa9.47□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W MEC1P38111 2368 aa9.47□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W TRA1P38811 3744 aa9.46□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W YER137CP40083 148 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W GON7P46984 123 aa9.46□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W UBP8P50102 471 aa9.46□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W SOL1P50278 321 aa9.46□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W MRPL50P53724 139 aa9.46□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W NRG1Q03125 231 aa9.46□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W YDR286CQ05530 114 aa9.46□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W RTT103Q05543 409 aa9.46□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W YLR365WQ7LIF2 110 aa9.46□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W MIR1P23641 311 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W TRR1P29509 319 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W SUA5P32579 426 aa9.45□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W MNS1P32906 549 aa9.45□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W RPB7P34087 171 aa9.45□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W NTC20P38302 140 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W OSH7P38755 437 aa9.45□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W VMA22P38784 181 aa9.45□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data9.45□□□□□ -0.9 RIP-Chip
RNQ1YCL028W BNA2P47125 453 aa9.45□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W HED1Q03937 162 aa9.45□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W PLP1Q04004 230 aa9.45□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W CAC2Q04199 468 aa9.45□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W LIP2Q06005 328 aa9.45□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W FEX2Q08991 375 aa9.45□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W VAM3Q12241 283 aa9.45□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W YOR192C-CQ3E736 78 aa9.45□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W PUT1P09368 476 aa9.44□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W ACB1P31787 87 aa9.44□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W VMA8P32610 256 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W LAG1P38703 411 aa9.44□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W AIM46P38885 310 aa9.44□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W GAT2P40209 560 aa9.44□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W BMT5P40493 336 aa9.44□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W NIF3P53081 288 aa9.44□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W YNL046WP53956 172 aa9.44□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W TIM10P87108 93 aa9.44□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W FIT1Q04433 528 aa9.44□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W PML1Q07930 204 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W FUS3P16892 353 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W OLE1P21147 510 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W SWD2P36104 329 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W SLM1P40485 686 aa9.43□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W THI74Q04083 370 aa9.43□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W TSA2Q04120 196 aa9.43□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W GMC1Q04399 608 aa9.43□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W FEX1Q08913 375 aa9.43□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W VMA3P25515 160 aa9.42□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W RPA34P47006 233 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W MEH1Q02205 184 aa9.42□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W YLR224WQ05947 369 aa9.42□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W YOL118CQ08259 102 aa9.42□□□□□ -0.9
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