RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	ZRT3	P34240	503 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	ECM31	P38122	312 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	ECM1	P39715	212 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	CCC1	P47818	322 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	SSN8	P47821	323 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	RMR1	P53060	241 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	SLI1	P53304	468 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	YLR152C	P54072	576 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	SNZ1	Q03148	297 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	ACL4	Q03771	387 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	TGS1	Q12052	315 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	PCL9	Q12477	304 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	HUT1	Q12520	339 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	ATG22	P25568	528 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	OAC1	P32332	324 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	THI2	P38141	450 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	MRX1	P40050	688 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	MRX5	P47007	382 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	YIP1	P53039	248 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	YGR016W	P53209	190 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	VIK1	Q12045	647 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	YOL114C	Q12322	202 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	FRE6	Q12473	712 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	PET122	P10355	254 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	YCR061W	P25639	631 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	MRPL6	P32904	214 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	ECT1	P33412	323 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	FLO10	P36170	1169 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	SWP82	P43554	623 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	HSK3	P69852	69 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	STD1	Q02794	444 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	UPS1	Q05776	175 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	YOL029C	Q08187	201 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	YOR186W	Q08560	144 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	ATG40	Q99325	256 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	YKL075C	P36083	450 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	SDH4	P37298	181 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	MDM31	P38880	579 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	PAC2	P39937	518 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	SYG1	P40528	902 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	YJL213W	P40896	331 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	EFM3	P47163	339 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	CAB4	P53332	305 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	BUD17	P53727	317 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	HOT1	Q03213	719 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	YLR283W	Q05867	314 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	PRM3	Q08931	133 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	WHI5	Q12416	295 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	VCX1	Q99385	411 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	ERG2	P32352	222 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	SDS22	P36047	338 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	ECM4	P36156	370 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	TOS8	P53147	276 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	POP6	P53218	158 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	MCH1	Q07376	486 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	OSW1	Q08692	278 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	YPL199C	Q08954	240 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	SWT1	Q12104	458 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	CNE1	P27825	502 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	ERV1	P27882	189 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	UTR5	P32630	166 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	CPR5	P35176	225 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	YKL063C	P35725	167 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	SHE1	P38200	338 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	ECM27	P47144	725 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	SRL4	Q03085	281 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	YML122C	Q03207	126 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	YMD8	Q03697	442 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	YHP1	Q04116	353 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	SMP3	Q04174	516 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 242.2 ms