RNA–Protein interactions for RNA: YJL135W

YJL135W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL135W, Length 318 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL135W	YJL135W	YAR1	P46683	200 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	USE1	P53146	245 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	GTR2	P53290	341 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	0.7	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	SNZ2	P53824	298 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	YLR030W	Q07967	263 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	YOR186W	Q08560	144 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	0.7	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	YPL257W	Q08974	193 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	0.7	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	OM45	P16547	393 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	0.69	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	EHD3	P28817	500 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	OAC1	P32332	324 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	YKR045C	P36138	183 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	MRX3	P38172	270 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	ERV15	P38312	142 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	GOS1	P38736	223 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	YHR022C	P38763	256 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	MEP1	P40260	492 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	RSM25	P40496	264 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	YKE4	P40544	346 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	RMR1	P53060	241 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	CYT2	Q00873	224 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	NUP49	Q02199	472 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	BTS1	Q12051	335 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	0.69	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	MSW1	P04803	379 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	SNA3	P14359	133 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	YAR068W	P39564	161 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	RTT105	P40063	208 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	YIL001W	P40560	513 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	GLG2	P47011	380 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	NEJ1	Q06148	342 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	ATG39	Q06159	398 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	YPR172W	Q06608	200 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	0.68	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	SIR4	P11978	1358 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	MSF1	P08425	469 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	KDX1	P36005	433 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	YBR096W	P38256	230 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	YBR219C	P38317	127 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	BIG1	P38813	335 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	GLE2	P40066	365 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	YJR056C	P47115	236 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	YNR062C	P53748	327 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	YCT1	Q12235	531 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	YHR180W	P38868	163 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.66	□□□□□ -2.3	not detected
YJL135W	YJL135W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	AGE2	P40529	298 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	ILM1	P47155	203 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	0.66	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	YNL046W	P53956	172 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	SEI1	Q06058	285 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	YLR162W	Q06235	118 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	ARR2	Q06597	130 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	HEM25	Q07534	307 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	CSM4	Q08955	156 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	YOL107W	Q12239	342 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	TPO4	Q12256	659 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	RSR1	P13856	272 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	FCY2	P17064	533 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	RIB7	P33312	244 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	CAT5	P41735	233 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	TOS8	P53147	276 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	0.65	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	CSI2	Q08054	341 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	MSH5	Q12175	901 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	FLO9	P39712	1322 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	ERD2	P18414	219 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	YBR063C	P38083	404 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	RPA43	P46669	326 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	NUP57	P48837	541 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	GPI8	P49018	411 aa		0.64	□□□□□ -2.31

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