RNA–Protein interactions for RNA: YHR133C

NSG1, Transcript of Protein involved in regulation of sterol biosynthesis, yeast

Gene NSG1, Length 876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSG1	YHR133C	API2	Q04413	109 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	MRL1	Q06815	381 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	YLR031W	Q07978	186 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	RSC58	Q07979	502 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	FSH3	Q99369	266 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	MET3	P08536	511 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	SAG1	P20840	650 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	MLF3	P32047	452 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	VAM7	P32912	316 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	YKL063C	P35725	167 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	FAT1	P38225	669 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	YBR242W	P38331	238 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	YIL029C	P40538	142 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	OTU1	P43558	301 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	SSN8	P47821	323 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	RSM27	P53305	110 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	YDC1	Q02896	317 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	YPR098C	Q06089	161 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	SCM3	Q12334	223 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	MEC1	P38111	2368 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	IFM1	P25038	676 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	YCR101C	P25607	182 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	MRPL3	P36516	390 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	MRPL36	P36531	177 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	SKP1	P52286	194 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	UFD1	P53044	361 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	GPG1	P53130	126 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	TYW3	P53177	273 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	CRZ1	P53968	678 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	YDR248C	Q03786	193 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	ENV7	Q12003	364 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.24	□□□□□ -1.73	not detected
NSG1	YHR133C	RDI1	Q12434	202 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	ERP4	Q12450	207 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	AAC1	P04710	309 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	GCN3	P14741	305 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	HNM1	P19807	563 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	ATG22	P25568	528 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	NAT2	P37293	288 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	EGT2	P42835	1041 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	MRPS16	Q02608	121 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	YMR254C	Q04838	102 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	PIN3	Q06449	215 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	YOR186W	Q08560	144 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	YOR385W	Q08909	290 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	EAF3	Q12432	401 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	HUT1	Q12520	339 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	BPH1	P25356	2167 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	REP2	P03872	296 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	URA3	P03962	267 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	SPS100	P13130	326 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	CPR4	P25334	318 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	PEX4	P29340	183 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	ACH1	P32316	526 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	FLO10	P36170	1169 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	LNP1	P38878	278 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	GWT1	P47026	490 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	DIE2	P50076	525 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	TAF4	P50105	388 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	SKO1	Q02100	647 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	YML018C	Q03730	393 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	YLR125W	Q12138	136 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	WHI5	Q12416	295 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NSG1	YHR133C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NSG1	YHR133C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NSG1	YHR133C	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NSG1	YHR133C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NSG1	YHR133C	IMP1	P28627	190 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NSG1	YHR133C	ERG3	P32353	365 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NSG1	YHR133C	FMT1	P32785	401 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NSG1	YHR133C	YOX1	P34161	385 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NSG1	YHR133C	YKL107W	P34251	309 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NSG1	YHR133C	SRL3	P36167	246 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NSG1	YHR133C	ALG14	P38242	237 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NSG1	YHR133C	YBR197C	P38306	217 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NSG1	YHR133C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74

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