RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP4	YHR069C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	RSC58	Q07979	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	MSI1	P13712	422 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	AGA2	P32781	87 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	YKL107W	P34251	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	MCH2	P36032	473 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	MRPL36	P36531	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	HPA3	P39979	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	YND1	P40009	630 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	RTT105	P40063	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	YIL029C	P40538	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	SYS1	P41544	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	TPN1	P53099	579 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	MTL1	P53214	551 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	SKO1	Q02100	647 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	PHO92	Q06390	306 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	RFU1	Q08003	200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	CHO1	P08456	276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	MET3	P08536	511 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	SAG1	P20840	650 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	YKL187C	P34231	750 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	CAT5	P41735	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	OTU1	P43558	301 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	BXI1	P48558	297 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	AVT4	P50944	713 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	UBC13	P52490	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	CRZ1	P53968	678 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	YKR005C	Q02203	525 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	CTF19	Q02732	369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	YMR279C	Q03263	540 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	HUT1	Q12520	339 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	ODC2	Q99297	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	PET54	P10834	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	CAP2	P13517	287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	DAL80	P26343	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	VAM7	P32912	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	YOX1	P34161	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	FAT1	P38225	669 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	YHR122W	P38829	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	GAT2	P40209	560 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	YGR042W	P53227	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	SED1	Q01589	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	PEX10	Q05568	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	YLR283W	Q05867	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	YPR098C	Q06089	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	YPL199C	Q08954	240 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	ENV7	Q12003	364 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	SRL2	Q12020	392 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	BPH1	P25356	2167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	PEX4	P29340	183 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	YKL063C	P35725	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	YKE4	P40544	346 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	EGT2	P42835	1041 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	GWT1	P47026	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	PEF1	P53238	335 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
RRP4	YHR069C	YDC1	Q02896	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	URA6	P15700	204 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	NPL6	P32832	435 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	ECM14	P38836	430 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	AIM20	P40451	204 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	SSN8	P47821	323 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	UFD1	P53044	361 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	AAC1	P04710	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	HYM1	P32464	399 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	FLO10	P36170	1169 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	TAF4	P50105	388 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	YDR248C	Q03786	193 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	PIN3	Q06449	215 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	YOR385W	Q08909	290 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	YLR108C	Q12259	485 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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