RNA–Protein interactions for RNA: YOR252W

TMA16, Transcript of Protein of unknown function that associates with ribosomes, yeast

Gene TMA16, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TMA16	YOR252W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	FIG1	P38224	298 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	BDH1	P39714	382 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	SOK1	P40317	901 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	PRM10	P42946	383 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	FLC3	P53121	802 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	PIN3	Q06449	215 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	YDL211C	Q12121	372 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	SEY1	Q99287	776 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	STH1	P32597	1359 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	SWI1	P09547	1314 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	SNA3	P14359	133 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	ATG15	P25641	520 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	RPB9	P27999	122 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.19	□□□□□ -1.9	not detected
TMA16	YOR252W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	SER33	P40510	469 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	SNX4	P47057	423 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	YDC1	Q02896	317 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	QCR7	P00128	127 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	QCR2	P07257	368 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	CPT1	P17898	393 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	YMR31	P19955	123 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	QRI5	P32344	111 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	MRX3	P38172	270 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	POP8	P38208	133 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	OPY1	P38271	328 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	PHO89	P38361	574 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	SRP14	P38985	146 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	AVT6	P40074	448 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	NBP35	P52920	328 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	GET1	P53192	235 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	PEX12	Q04370	399 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	SPC24	Q04477	213 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	YDL144C	Q07589	356 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	SNF8	Q12483	233 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	PET20	Q99373	253 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	PHO80	P20052	293 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.17	□□□□□ -1.9	not detected
TMA16	YOR252W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	YJR056C	P47115	236 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	SWS2	P53937	143 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	CTF19	Q02732	369 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	SDC1	Q03323	175 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	YDR248C	Q03786	193 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	LOA1	Q06508	300 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	YOL019W	Q08157	551 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	NUF2	P33895	451 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	FES1	P38260	290 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	VMA22	P38784	181 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	POG1	P40473	351 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	YGL235W	P53071	178 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	KRE28	Q04431	385 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	MDS3	P53094	1487 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TMA16	YOR252W	PUT1	P09368	476 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	ERG2	P32352	222 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	HMT1	P38074	348 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	MED8	P38304	223 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	TRR2	P38816	342 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	SYS1	P41544	203 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	RPE1	P46969	238 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	YJR149W	P47177	404 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	NIF3	P53081	288 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	YGL204C	P53089	101 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	YGR042W	P53227	271 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	YNL095C	P53932	642 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	ASI3	P53983	676 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	PEX10	Q05568	337 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	CSM4	Q08955	156 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	CUP2	P15315	225 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	RPO26	P20435	155 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	JEN1	P36035	616 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	CAF4	P36130	643 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	FZO1	P38297	855 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	YHI9	P38765	294 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	TRM5	P38793	499 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
TMA16	YOR252W	SBH2	P52871	88 aa		3.14	□□□□□ -1.91

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