RNA–Protein interactions for RNA: YOR054C

VHS3, Transcript of Negative regulatory subunit of protein phosphatase 1 Ppz1p, yeast

Gene VHS3, Length 2,025 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VHS3	YOR054C	IMG1	P25626	169 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	SKN1	P33336	771 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	EMC3	P36039	253 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	FUI1	P38196	639 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	CHL4	P38907	458 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	POP2	P39008	433 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YER158C	P40095	573 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YIL165C	P40446	119 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	RMD8	P43620	662 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	TRM9	P49957	279 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	RSM23	Q01163	450 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	EST3	Q03096	181 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	EKI1	Q03764	534 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	UPS3	Q04006	179 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	AVO2	Q04749	426 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	HEM25	Q07534	307 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	NAT5	Q08689	176 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	MMT2	Q08970	484 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	BTS1	Q12051	335 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	PHO2	P07269	559 aa		3.74	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	RBK1	P25332	333 aa		3.74	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	ELO2	P25358	347 aa		3.74	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	ADH7	P25377	361 aa		3.74	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	BOS1	P25385	244 aa		3.74	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.74	□□□□□ -1.81	not detected
VHS3	YOR054C	TIP20	P33891	701 aa		3.74	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	SUR2	P38992	349 aa		3.74	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.74	□□□□□ -1.81	not detected
VHS3	YOR054C	STE24	P47154	453 aa		3.74	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YJR120W	P47157	116 aa		3.74	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	MGA1	P53050	456 aa		3.74	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YAP1802	P53309	568 aa		3.74	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	PIN3	Q06449	215 aa		3.74	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YLR040C	Q07988	224 aa		3.74	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	VAM3	Q12241	283 aa		3.74	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	TPO4	Q12256	659 aa		3.74	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		3.74	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	POP5	P28005	173 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	SEC17	P32602	292 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	TRS65	P32893	560 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	RIB5	P38145	238 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	BNA4	P38169	460 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	SKN7	P38889	622 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	ELO3	P40319	345 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YDL183C	P48569	320 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	LYS5	P50113	272 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	FLC3	P53121	802 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	OAZ1	Q02803	292 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YML096W	Q04489	525 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	IPK1	Q06667	281 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	SHS1	Q07657	551 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	ATG10	Q07879	167 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	HRD1	Q08109	551 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	BSC1	Q12140	328 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	ZPS1	Q12512	249 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	POX1	P13711	748 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	STP22	P25604	385 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	ATS1	P31386	333 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	PRY2	P36110	329 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	PAU24	P38155	120 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YAR1	P46683	200 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	EXG2	P52911	562 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	PEX31	P53203	462 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	APJ1	P53940	528 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YDR248C	Q03786	193 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YMR252C	Q04814	134 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	ATG39	Q06159	398 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	PEX30	Q06169	523 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	TDA6	Q06466	467 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	BSP1	Q06604	576 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	CTR3	Q06686	241 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	COQ10	Q08058	207 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	CRT10	Q08226	957 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	MET32	Q12041	191 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.73	□□□□□ -1.81	not detected
VHS3	YOR054C	YLR118C	Q12354	227 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	COX19	Q3E731	98 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	SLO1	Q3E784	85 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81

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