RNA–Protein interactions for RNA: YHR213W-B

YHR213W-B, Transcript of Pseudogenic fragment with similarity to flocculins, yeastyeast

Gene YHR213W-B, Length 300 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR213W-BYHR213W-B SEC66P33754 206 aa5.67□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B SSH1P38353 490 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B AVT7P40501 490 aa5.67□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B PAM16P42949 149 aa5.67□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B CTK2P46962 323 aa5.67□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B YJR120WP47157 116 aa5.67□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B IMD3P50095 523 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B SIP18P50263 79 aa5.67□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B MTL1P53214 551 aa5.67□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B POP6P53218 158 aa5.67□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B SCW4P53334 386 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B YNR048WP53740 393 aa5.67□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data5.67□□□□□ -1.5not detected
YHR213W-BYHR213W-B HAS1Q03532 505 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B API2Q04413 109 aa5.67□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B PEX27Q08580 376 aa5.67□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B ATG41Q12048 136 aa5.67□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B ORT1Q12375 292 aa5.67□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B ISA2Q12425 185 aa5.67□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B RPI1P23250 407 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B AFG1P32317 509 aa5.66□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B SPT14P32363 452 aa5.66□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B MRPS5P33759 307 aa5.66□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B MKS1P34072 584 aa5.66□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B YHK8P38776 514 aa5.66□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B IPI1P38803 334 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B SOL3P38858 249 aa5.66□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B MSS4P38994 779 aa5.66□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B YMR144WP40214 342 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B SYS1P41544 203 aa5.66□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B IRC18P47056 224 aa5.66□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B CWC23P52868 283 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B RAI1P53063 387 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B MRH4P53166 561 aa5.66□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B TPO3Q06451 622 aa5.66□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B MRL1Q06815 381 aa5.66□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B NUM1Q00402 2748 aa5.65□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B COX5BP00425 151 aa5.65□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B PHO4P07270 312 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B MET3P08536 511 aa5.65□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B SPS4P09937 338 aa5.65□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B RPL30P14120 105 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B ERG4P25340 473 aa5.65□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B CNE1P27825 502 aa5.65□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B SBA1P28707 216 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B PPZ2P33329 710 aa5.65□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B YJL016WP47072 561 aa5.65□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B YIP5P53108 310 aa5.65□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B PXR1P53335 271 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B ERV29P53337 310 aa5.65□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B YNL092WP53934 400 aa5.65□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B NMA1Q06178 401 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B YPR196WQ06595 470 aa5.65□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B SSK1Q07084 712 aa5.65□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B RFU1Q08003 200 aa5.65□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B FIT3Q08907 204 aa5.65□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B YPL199CQ08954 240 aa5.65□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B SRL2Q12020 392 aa5.65□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B WTM2Q12206 467 aa5.65□□□□□ -1.5
YHR213W-BYHR213W-B CHO1P08456 276 aa5.64□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B RPL43BP0CX26 92 aa5.64□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B CAP2P13517 287 aa5.64□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B ARO3P14843 370 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B DEG1P31115 442 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B HYM1P32464 399 aa5.64□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data5.64□□□□□ -1.51not detected
YHR213W-BYHR213W-B CLB6P32943 380 aa5.64□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B YGP1P38616 354 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B TOK1P40310 691 aa5.64□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B ARO8P53090 500 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B YIP4P53093 235 aa5.64□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B TPN1P53099 579 aa5.64□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B YGL159WP53110 370 aa5.64□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B CTF19Q02732 369 aa5.64□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B PEX10Q05568 337 aa5.64□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B MRX9Q07349 420 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B MSS1P32559 526 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B NPL6P32832 435 aa5.63□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B REC114P32841 428 aa5.63□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B ARC40P38328 384 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B PRS3P38689 320 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B PIG2P40187 538 aa5.63□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B BUD8P41698 603 aa5.63□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B AVT4P50944 713 aa5.63□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B RNH201P53942 307 aa5.63□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B SPR28Q04921 423 aa5.63□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B KEI1Q06346 221 aa5.63□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B ASR1Q06834 288 aa5.63□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B RRS1Q08746 203 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B TRA1P38811 3744 aa5.62□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B CYC1P00044 109 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B SGA1P08019 549 aa5.62□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B CDC34P14682 295 aa5.62□□□□□ -1.51
YHR213W-BYHR213W-B HXT2P23585 541 aa5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.6 ms