RNA–Protein interactions for RNA: YHR171W

ATG7, Transcript of Autophagy-related protein and dual specificity member of the E1 family, yeast

Gene ATG7, Length 1,893 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG7	YHR171W	MED8	P38304	223 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	BDH1	P39714	382 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	COG5	P53951	403 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	GAS2	Q06135	555 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	OXA1	P39952	402 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	YOL019W	Q08157	551 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	PCL9	Q12477	304 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	CSR2	Q12734	1121 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	MGT1	P26188	188 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	ARO7	P32178	256 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	CIN5	P40917	295 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	FMP32	P43557	207 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	TPC1	P53257	314 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	YML018C	Q03730	393 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	SPG4	Q04438	115 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	HEM4	P06174	275 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	ATG15	P25641	520 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	CPR7	P47103	393 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	COS6	P53344	381 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	TDA1	Q03533	586 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	FAR10	Q06001	478 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	COX5A	P00424	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	MRS1	P07266	363 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
ATG7	YHR171W	CHL4	P38907	458 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	COX14	P39103	70 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	PEX22	P39718	180 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	LCB3	P47013	409 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	YGL082W	P53155	381 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	PIR3	Q03180	325 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	INM2	Q05533	292 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	RFU1	Q08003	200 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	TFC7	Q12415	435 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	OAC1	P32332	324 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	GPX1	P36014	167 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	PAN6	P40459	309 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	SDC1	Q03323	175 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	YET2	Q04210	160 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ATG7	YHR171W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	GCN3	P14741	305 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	FUN26	P31381	517 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	IRC24	P40580	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	BXI1	P48558	297 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	DYN3	Q04949	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	MIM1	Q08176	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	RAD50	P12753	1312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	YCR023C	P25351	611 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	MIX23	P38162	196 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	MBA1	P38300	278 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	MOB2	P43563	287 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	PET191	Q02772	108 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	HOT13	P36078	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	MRP21	P38175	177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	YHL049C	P38722	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	HEM14	P40012	539 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	ERV2	Q12284	196 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	TCA17	P32613	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	ECM14	P38836	430 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	AZF1	P41696	914 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	HRT3	Q12347	344 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	RPN13	O13563	156 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	COS2	P0CX12	379 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	COS3	P0CX13	379 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	MDM10	P18409	493 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	SNX4	P47057	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	UBC12	P52491	188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	NRM1	P53718	249 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	YPD1	Q07688	167 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	OSW1	Q08692	278 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	EAF3	Q12432	401 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.6 ms