RNA–Protein interactions for RNA: YGL093W

SPC105, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeastyeast

Gene SPC105, Length 2,754 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105YGL093W CTK2P46962 323 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W LYS5P50113 272 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W POP6P53218 158 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W YDC1Q02896 317 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W HLR1Q04429 423 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W MCM21Q06675 368 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W SSK1Q07084 712 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W THI72Q08579 599 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W YLR099W-AQ3E798 87 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W MES1P00958 751 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W GCN4P03069 281 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W KIN28P06242 306 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W RPS23BP0CX30 145 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W CDC34P14682 295 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W STE18P18852 110 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W SED4P25365 1065 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W BOS1P25385 244 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W MSS1P32559 526 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W TCA17P32613 152 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W MRPS5P33759 307 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W ARO9P38840 513 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W PIG2P40187 538 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W TOK1P40310 691 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W YIL029CP40538 142 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W SKP1P52286 194 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W DMA2P53924 522 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W YNL046WP53956 172 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W GPI17Q04080 534 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W DLT1Q04216 342 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W SUS1Q6WNK7 96 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W YBL113CQ7M4S9 792 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W HIS3P06633 220 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W SGA1P08019 549 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W YML003WP0CF16 290 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W RPL30P14120 105 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W RPL24BP24000 155 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W RFA3P26755 122 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W HYM1P32464 399 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data3.57□□□□□ -1.84not detected
SPC105YGL093W PPZ2P33329 710 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W TMA19P35691 167 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W SSH1P38353 490 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W LSM1P47017 172 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W IMO32P53219 342 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W SOG2Q08817 791 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W FIT3Q08907 204 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W ERP4Q12450 207 aa3.57□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W IFM1P25038 676 aa3.56□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W TCM62P38228 572 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W ATG18P43601 500 aa3.56□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W MGR3Q04472 501 aa3.56□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W MRX10Q05648 414 aa3.56□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W YRM1Q12340 786 aa3.56□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W ORT1Q12375 292 aa3.56□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W TDH2P00358 332 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W APA2P22108 325 aa3.56□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W PRM5P40476 318 aa3.56□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W YGL159WP53110 370 aa3.56□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W GIM3P53900 129 aa3.56□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W YKR005CQ02203 525 aa3.56□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W YPL067CQ02754 198 aa3.56□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W MRP51Q02950 344 aa3.56□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W GMC1Q04399 608 aa3.56□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W MRPL35Q06678 367 aa3.56□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W NGL1Q08213 363 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W IES3Q12345 250 aa3.56□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W COX5BP00425 151 aa3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W HOM6P31116 359 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W ISC10P32645 267 aa3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W MKS1P34072 584 aa3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W MTR2P34232 184 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W MRPL36P36531 177 aa3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W YHL044WP38727 235 aa3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W LNP1P38878 278 aa3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W EGT2P42835 1041 aa3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W LYS20P48570 428 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W AVT4P50944 713 aa3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W SBH2P52871 88 aa3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W DOC1P53068 250 aa3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W ARO8P53090 500 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W TPN1P53099 579 aa3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W NSA1P53136 463 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W YMR252CQ04814 134 aa3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W YMR254CQ04838 102 aa3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W LYS21Q12122 440 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W FSH3Q99369 266 aa3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W HNM1P19807 563 aa3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W CPR2P23285 205 aa3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W ERG24P32462 438 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W OSH7P38755 437 aa3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W MSS4P38994 779 aa3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W MSS11Q03825 758 aa3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W HNT1Q04344 158 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W ECM18Q04623 453 aa3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W GRC3Q07845 632 aa3.55□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W ARO7P32178 256 aa3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W SPT14P32363 452 aa3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W MNS1P32906 549 aa3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W RIB7P33312 244 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 59.9 ms