RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C YEL057CP39983 233 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SHO1P40073 367 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C AVT6P40074 448 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MSS2P40990 351 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C STB1P42845 420 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YGR066CP53242 292 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YGR126WP53274 230 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C RRN9P53437 365 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MPP6P53725 186 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C PGA1P53896 198 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C TMA20P89886 181 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C GRX5Q02784 150 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YPL039WQ03080 316 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SDC1Q03323 175 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C OST6Q03723 332 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C ATG17Q06410 417 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MLC2Q06580 163 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C IRC19Q07843 230 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C HRT1Q08273 121 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C RDL2Q08742 149 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YPL272CQ08984 517 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SIA1Q12212 622 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C RLM1Q12224 676 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YOR343CQ12484 108 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SET6Q12529 373 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MED11Q99278 115 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C Q0144Q9ZZW2 109 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C FLO9P39712 1322 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YAL064W-BO13512 126 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C IPP1P00817 287 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C RPL15AP05748 204 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MET17P06106 444 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C PEP4P07267 405 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MET2P08465 486 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C PDX1P16451 410 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C PHO80P20052 293 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C UTR1P21373 530 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MDH2P22133 377 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C ERG9P29704 444 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C VPH2P32341 215 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data1.94□□□□□ -2.1not detected
GCN4YEL009C NDC1P32500 655 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SUR1P33300 382 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data1.94□□□□□ -2.1not detected
GCN4YEL009C COS9P36034 407 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C GOS1P38736 223 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MLH1P38920 769 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C GDI1P39958 451 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YER184CP39961 794 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C KRE29P40026 464 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C RIO2P40160 425 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C RFC4P40339 323 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C NAS2P40555 220 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C CTK2P46962 323 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MNN5P46982 586 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C BRR6P53062 197 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C PKP2P53170 491 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C RPN14P53196 417 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C NQM1P53228 333 aaPredicted RBP1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C OGG1P53397 376 aaPredicted RBP1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C BSC5P53755 489 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SPO19Q03029 223 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SNZ1Q03148 297 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SCS7Q03529 384 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SPC19Q03954 165 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YMR087WQ04299 284 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C RNH1Q04740 348 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C GAS2Q06135 555 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C RRP9Q06506 573 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C TAZ1Q06510 381 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C GRE1Q08969 168 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SWT1Q12104 458 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C TRM10Q12400 293 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SFG1Q12507 346 aa1.94□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C TEL1P38110 2787 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C CYR1P08678 2026 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C KIN28P06242 306 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C CBP6P07253 162 aaPredicted RBP1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C NFT1P0CE68 1218 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data1.93□□□□□ -2.1not detected
GCN4YEL009C CAM1P29547 415 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C VMA6P32366 345 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YEL045CP32616 141 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YME2P32843 850 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C CHK1P38147 527 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MAL32P38158 584 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SHE1P38200 338 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YHR035WP38769 630 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C PHO90P39535 881 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C BUR6P40096 142 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C POP1P41812 875 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SFH5P47008 294 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C VOA1P53262 265 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MAL12P53341 584 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MNT4P53745 580 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C NUP49Q02199 472 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C NUP116Q02630 1113 aa1.93□□□□□ -2.1
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