RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	PRP28	P23394	588 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	BOS1	P25385	244 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	RER1	P25560	188 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	DGR2	P32330	852 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	SRO77	P38163	1010 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	SLM1	P40485	686 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	COG2	P53271	262 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	TIM44	Q01852	431 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	YDC1	Q02896	317 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	THP1	Q08231	455 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	MCH4	Q08268	501 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	ACF2	Q12168	779 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	SIA1	Q12212	622 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	YDL199C	Q12407	687 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	YPT6	Q99260	215 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	MSW1	P04803	379 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	OPI3	P05375	206 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	CSM1	P25651	190 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	GSH1	P32477	678 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	YKL069W	P36088	180 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	PHO90	P39535	881 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	TDA10	P42938	290 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	IRC5	P43610	853 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	UFD1	P53044	361 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	RRN5	Q02983	363 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	HSP31	Q04432	237 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	TRM13	Q12383	476 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	MRPS28	P21771	286 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
SYF2	YGR129W	MRE11	P32829	692 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	YME2	P32843	850 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	YBR241C	P38142	488 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	MLH1	P38920	769 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	MPM1	P40364	252 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	IAH1	P41734	238 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	PMT6	P42934	759 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	IDS2	P46958	469 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	MDE1	P47095	244 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	WSC2	P53832	503 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	ASI3	P53983	676 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	GTB1	Q04924	702 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	DYN3	Q04949	312 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	SFH1	Q06168	426 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	NAM2	P11325	894 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	CPR2	P23285	205 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	AFR1	P33304	620 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	YOX1	P34161	385 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	FLO5	P38894	1075 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	HPM1	P40481	377 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	SSY5	P47002	699 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	LOH1	P47055	219 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	RRI1	Q12468	440 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	ADE8	P04161	214 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	STE50	P25344	346 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	SUR1	P33300	382 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	MCH2	P36032	473 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	ATF1	P40353	525 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	GTR1	Q00582	310 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	RSM23	Q01163	450 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	YMR166C	Q03829	368 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	GPI17	Q04080	534 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	DLT1	Q04216	342 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	HFD1	Q04458	532 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	NNT1	Q05874	261 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	GGA1	Q06336	557 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	PSR1	Q07800	427 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	SPC3	Q12133	184 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.72	□□□□□ -1.65	not detected
SYF2	YGR129W	SCEI	P03882	235 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	MTC7	P32633	139 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	PEX6	P33760	1030 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	MRP8	P35719	219 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	YKR015C	P36111	568 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	PEX32	P38292	413 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	SDP1	P40479	209 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	BNA1	P47096	177 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	RNH201	P53942	307 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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