RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C HXT11P54862 567 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YSA1Q01976 231 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C ABZ2Q03266 374 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YDR209CQ03480 137 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SNX41Q04053 625 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SNO4Q04902 237 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C BUR2Q05949 395 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YDL218WQ07629 317 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C HSP33Q08914 237 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C UIP4Q08926 304 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C HSP32Q08992 237 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YDL109CQ12103 647 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C MCP1Q12106 302 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SPC3Q12133 184 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C APC2Q12440 853 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YPL119C-AQ3E751 87 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C MHF1Q3E835 90 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YOR032W-AQ8TGS1 66 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C DET1Q99288 334 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SLH1P53327 1967 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C FMP27Q06179 2628 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C POL2P21951 2222 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YBR056W-AI2HB52 66 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C GAL1P04385 528 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YFR010W-AP0C5N0 62 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YHR214C-DP0CX93 97 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YPK2P18961 677 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SCO1P23833 295 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C ADH7P25377 361 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C HSP30P25619 332 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C OAC1P32332 324 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SLC1P33333 303 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C LHS1P36016 881 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C TPO5P36029 618 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C RTC2P38279 296 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C ARN2P38724 620 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C APE4P38821 490 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C TDA11P38854 504 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YHR180WP38868 163 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C EGD2P38879 174 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SOP4P39543 234 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YER010CP40011 234 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C ISC1P40015 477 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YIL060WP40519 144 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C HIS6P40545 261 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C REE1P40893 198 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YJL213WP40896 331 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SWP82P43554 623 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MDE1P47095 244 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C PGU1P47180 361 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C COS10P52924 374 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YGL235WP53071 178 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YGL101WP53144 215 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YNR062CP53748 327 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C COS1P53822 381 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MOT3P54785 490 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C TLG1Q03322 224 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C DML1Q03652 475 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YMD8Q03697 442 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YDR249CQ03787 373 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MIX14Q04341 121 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SEC13Q04491 297 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C ELP6Q04868 273 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C COX20Q04935 205 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YLR345WQ06137 509 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YPR127WQ06494 345 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C COQ10Q08058 207 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C HNT3Q08702 217 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C RDR1Q08904 546 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C BTS1Q12051 335 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C TMS1Q12116 473 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YRA1Q12159 226 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YOL114CQ12322 202 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C PST2Q12335 198 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YRM1Q12340 786 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C NKP1Q12493 238 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MTR10Q99189 972 aa1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C DPM1P14020 267 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C CTA1P15202 515 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C RPB8P20436 146 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C IDP1P21954 428 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C CLB2P24869 491 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C EHD3P28817 500 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C AGA1P32323 725 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YEF1P32622 495 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MSN4P33749 630 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C GPX1P36014 167 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YKL071WP36086 256 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C ECM4P36156 370 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C CHL4P38907 458 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C IPT1P38954 527 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C FET3P38993 636 aa1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data1.95□□□□□ -2.1not detected
GCN4YEL009C PTI1P39927 425 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C AIM10P39965 576 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
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