RNA–Protein interactions for RNA: YDL033C

SLM3, Transcript of tRNA-specific 2-thiouridylase, yeastyeast

Gene SLM3, Length 1,254 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3YDL033C ADE1P27616 306 aa7.15□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C HOG1P32485 435 aa7.15□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C RPD3P32561 433 aa7.15□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data7.15□□□□□ -1.26not detected
SLM3YDL033C PPG1P32838 368 aa7.15□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C YNK1P36010 153 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C RFC2P40348 353 aa7.15□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C MET28P40573 187 aa7.15□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C SNM1P40993 198 aa7.15□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C PAM16P42949 149 aa7.15□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C RTS3P53289 263 aa7.15□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C GIM3P53900 129 aa7.15□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C SMA2Q04658 369 aa7.15□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C TEN1Q07921 160 aa7.15□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C HTS1P07263 546 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C RPB3P16370 318 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C ATS1P31386 333 aa7.14□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C DTR1P38125 572 aa7.14□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C HSE1P38753 452 aa7.14□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C YHR177WP38867 453 aa7.14□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C LRO1P40345 661 aa7.14□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C EMC5P40540 141 aa7.14□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C VMA21P41806 77 aa7.14□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C NNF1P47149 201 aa7.14□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C PAC10P48363 199 aa7.14□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C LYS20P48570 428 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C KXD1P53158 218 aa7.14□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C HCH1P53834 153 aa7.14□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C RHO3Q00245 231 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data7.14□□□□□ -1.27not detected
SLM3YDL033C FIT1Q04433 528 aa7.14□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C CYK3Q07533 885 aa7.14□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C RAD28Q12021 506 aa7.14□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C YPR011CQ12251 326 aa7.14□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C FRE7Q12333 620 aa7.14□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C FRE6Q12473 712 aa7.14□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C SET6Q12529 373 aa7.14□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C CDC28P00546 298 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C RPS31P05759 152 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C PHO2P07269 559 aa7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C YAR066WP0CX18 203 aa7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C YHR214WP0CX19 203 aa7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C RSC6P25632 483 aa7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C CDC50P25656 391 aa7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C NTH1P32356 751 aa7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C PAU2P32612 120 aa7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C SOL2P37262 315 aa7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C THI2P38141 450 aa7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C SHG1P38337 142 aa7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C GIM4P40005 111 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C FAU1P40099 211 aa7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C POP1P41812 875 aa7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C HXT14P42833 540 aa7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C SPG5P42933 373 aa7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C GAT1P43574 510 aa7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C PMT3P47190 753 aa7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C TIM21P53220 239 aa7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C GPI15P53961 229 aa7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C ROT1Q03691 256 aa7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C TPP1Q03796 238 aa7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C SPC19Q03954 165 aa7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C PEX30Q06169 523 aa7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C NDE2Q07500 545 aa7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C DCI1Q08558 271 aa7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C YJR112W-AQ3E743 109 aa7.13□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C YBR056W-AI2HB52 66 aa7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C MDM35O60200 86 aa7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C YML003WP0CF16 290 aa7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C YPK2P18961 677 aa7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C PTP1P25044 335 aa7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C SLM5P25345 492 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C YCR006CP25350 157 aa7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C PBN1P25580 416 aa7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C FAA1P30624 700 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C MRPL15P36523 253 aa7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C SDH4P37298 181 aa7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C TRM7P38238 310 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C AXL2P38928 823 aa7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C SSN3P39073 555 aa7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C SDP1P40479 209 aa7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C NIT2P47016 307 aa7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C YHC3P47040 408 aa7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C UBX6P47049 396 aa7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C DAN1P47178 298 aa7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C MDM34P53083 459 aa7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C YGR015CP53208 328 aa7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C YMR252CQ04814 134 aa7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C MED7Q08278 222 aa7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C ATX2Q12067 313 aa7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C PST1Q12355 444 aa7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa7.12□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C ADH3P07246 375 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C MRP1P10662 321 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C SFA1P32771 386 aa7.11□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C KAE1P36132 386 aa7.11□□□□□ -1.27
SLM3YDL033C MRPL4P36517 319 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 55.1 ms