RNA–Protein interactions for RNA: YOL006C

TOP1, Transcript of Topoisomerase I, yeast

Gene TOP1, Length 2,310 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOP1	YOL006C	PMT4	P46971	762 aa		3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	TRM9	P49957	279 aa		3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	ORC5	P50874	479 aa		3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YNR048W	P53740	393 aa		3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	HCH1	P53834	153 aa		3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YMR166C	Q03829	368 aa		3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YPR098C	Q06089	161 aa		3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	DIC1	Q06143	298 aa		3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	ORM2	Q06144	216 aa		3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YLR012C	Q07927	99 aa		3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YLR031W	Q07978	186 aa		3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	REV3	P14284	1504 aa		3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	EDE1	P34216	1381 aa		3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SPT3	P06844	337 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	CUP2	P15315	225 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	EXO70	P19658	623 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	PHO80	P20052	293 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	MAK32	P23060	363 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	PPH21	P23594	369 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YKL075C	P36083	450 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SEN34	P39707	275 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	AIM23	P47015	356 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	MDV1	P47025	714 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	UBC13	P52490	153 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	COS6	P53344	381 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	TAF10	Q12030	206 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	TPO4	Q12256	659 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	IFM1	P25038	676 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YMC2	P38087	329 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	ATG12	P38316	186 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	DFG10	P40526	253 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	OST3	P48439	350 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	COG5	P53951	403 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	INM2	Q05533	292 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YLR126C	Q12288	251 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	DNF1	P32660	1571 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YOR1	P53049	1477 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SAL1	D6W196	494 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	COS2	P0CX12	379 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	COS3	P0CX13	379 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YAR066W	P0CX18	203 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YHR214W	P0CX19	203 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	ERG4	P25340	473 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	COQ3	P27680	312 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	TIR2	P33890	251 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	EXO1	P39875	702 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	VPS52	P39904	641 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	OXA1	P39952	402 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YER076C	P40049	302 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YGR201C	P42936	225 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	VHT1	P53241	593 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.98	□□□□□ -1.93	not detected
TOP1	YOL006C	FYV6	P53913	173 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	GLO2	Q05584	274 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	TAZ1	Q06510	381 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	RPN6	Q12377	434 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	AGC1	Q12482	902 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	MDS3	P53094	1487 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	REP1	P03871	373 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	BI2	P03873	423 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YOL163W	P0CF20	169 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	CAP2	P13517	287 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	MGT1	P26188	188 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	FRE2	P36033	711 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	KAE1	P36132	386 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	KRE29	P40026	464 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YIL169C	P40442	995 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YNL320W	P42840	284 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	NUP100	Q02629	959 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YMR279C	Q03263	540 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YMR027W	Q04371	470 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SWF1	Q04629	336 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	TMA10	Q06177	86 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	TDA6	Q06466	467 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	MMT2	Q08970	484 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	BBP1	Q12365	385 aa		2.98	□□□□□ -1.93

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