RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeastyeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPT53YNL093W SSY5P47002 699 aa3.66□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W MIC26P50087 233 aa3.66□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W COS12P53053 380 aa3.66□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W ALG13P53178 202 aa3.66□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W JAC1P53193 184 aa3.66□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W COX18P53239 316 aa3.66□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W MSO1P53604 210 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W COS1P53822 381 aa3.66□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W ACT1P60010 375 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W SED5Q01590 340 aa3.66□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W YKR005CQ02203 525 aa3.66□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W MSC1Q03104 513 aa3.66□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W TDA1Q03533 586 aa3.66□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W YMR087WQ04299 284 aa3.66□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W TMN2Q04562 672 aa3.66□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W SUE1Q06524 206 aa3.66□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W SSK1Q07084 712 aa3.66□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W MRX9Q07349 420 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W CYK3Q07533 885 aa3.66□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W HEM25Q07534 307 aa3.66□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W IRC10Q08118 586 aa3.66□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W YLR046CQ12253 270 aa3.66□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W ECM3Q99252 613 aa3.66□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W BUD4P47136 1447 aa3.66□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W SPP41P38904 1435 aa3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W ADE4P04046 510 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W AAC1P04710 309 aa3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W ERD1P16151 362 aa3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W SCO1P23833 295 aa3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W MGT1P26188 188 aa3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W RFA2P26754 273 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W RPC19P28000 142 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W UGX2P32772 223 aa3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W PTC1P35182 281 aa3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W INM1P38710 295 aa3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W IPI1P38803 334 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W YHR127WP38833 243 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W KRE29P40026 464 aa3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W ARG2P40360 574 aa3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W BIR1P47134 954 aa3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W ASN1P49089 572 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W POP6P53218 158 aa3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W TIM8P57744 87 aa3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W APS2Q00381 147 aa3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W CCE1Q03702 353 aa3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W YDR249CQ03787 373 aa3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W CTK1Q03957 528 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W YMR027WQ04371 470 aa3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W SEC13Q04491 297 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W FMP42Q04991 504 aa3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W INM2Q05533 292 aa3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W GAS2Q06135 555 aa3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W ATG39Q06159 398 aa3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W CTR3Q06686 241 aa3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W SGT1Q08446 395 aa3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W GEP5Q12393 293 aa3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W IZH4Q99393 312 aa3.65□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W MMS1Q06211 1407 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W SAL1D6W196 494 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W MES1P00958 751 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W CYC3P06182 269 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W RHO2P06781 192 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W PHO2P07269 559 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W RIP1P08067 215 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W SEC59P20048 519 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W PHO80P20052 293 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W PUP3P25451 205 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W YCR102CP25608 368 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W TAH1P25638 111 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W HRR25P29295 494 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W SPS18P32572 300 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W SKN1P33336 771 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W OAR1P35731 278 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W ECM31P38122 312 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W YBR137WP38276 179 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W MTC4P38335 694 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W CHL4P38907 458 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W MET30P39014 640 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W VMA7P39111 118 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W PHO90P39535 881 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W YNL195CP40168 261 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W GAT2P40209 560 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W YCH1P42937 148 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W FAR7P43592 221 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W NUP57P48837 541 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W ORC5P50874 479 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W UBC11P52492 156 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W COG7P53195 279 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W CAF40P53829 373 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W IMP4P53941 290 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W RAV2Q03956 351 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W YDR391CQ04170 232 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W TRM12Q04235 462 aa3.64□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W YDR109CQ04585 715 aa3.64□□□□□ -1.83
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