RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W SUT1P53032 299 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W TYW3P53177 273 aa7.67□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W YGR168CP53293 376 aa7.67□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W RRN9P53437 365 aa7.67□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W TFB3Q03290 321 aa7.67□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W YDL114WQ07530 308 aa7.67□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W RAX2Q12465 1220 aa7.67□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa7.67□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W RPC40P07703 335 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W STE18P18852 110 aa7.66□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W CMK2P22517 447 aa7.66□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W ASF2P32448 525 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W PRP19P32523 503 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W YNK1P36010 153 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W SSY5P47002 699 aa7.66□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W MDE1P47095 244 aa7.66□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W GEP7P53171 287 aa7.66□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W PEX12Q04370 399 aa7.66□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W YDR114CQ04597 100 aa7.66□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W ATG26Q06321 1198 aa7.66□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W YPR196WQ06595 470 aa7.66□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W ASA1Q06822 443 aa7.66□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W IRC25Q07951 179 aa7.66□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W STE50P25344 346 aa7.65□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W YME2P32843 850 aa7.65□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W ARO9P38840 513 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W MLH1P38920 769 aa7.65□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W YER184CP39961 794 aa7.65□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W SAM37P50110 327 aa7.65□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W GET1P53192 235 aa7.65□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W SUB1P54000 292 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W RRP9Q06506 573 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W PSR1Q07800 427 aa7.65□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W SRL1Q08673 210 aa7.65□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W SIA1Q12212 622 aa7.65□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W NFI1Q12216 726 aa7.65□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W TY1A-BLQ12266 440 aa7.65□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W DPM1P14020 267 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W GPI18P38211 433 aa7.64□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W AMN1P38285 549 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W RBG1P39729 369 aa7.64□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W IDS2P46958 469 aa7.64□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W LOH1P47055 219 aa7.64□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W NOP9P47077 666 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W RPA14P50106 137 aa7.64□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W SPR6Q01684 191 aa7.64□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W YMR102CQ03177 834 aa7.64□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W RSA3Q05942 220 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W ACF2Q12168 779 aa7.64□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W YGR035W-AQ45U48 73 aa7.64□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W RAS1P01119 309 aa7.63□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W YER190C-BP0CX94 160 aa7.63□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W YEL077W-AP0CX95 160 aa7.63□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W YGR296C-BP0CX96 160 aa7.63□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W YPL283W-BP0CX97 160 aa7.63□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W YPR204C-AP0CX98 160 aa7.63□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W YFL068WP0CX99 160 aa7.63□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W YLL066W-AP0CY00 160 aa7.63□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W YLL067W-AP0CY01 160 aa7.63□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W SKG1P36169 355 aa7.63□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W CTF8P38877 133 aa7.63□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W TAX4P47030 604 aa7.63□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W NSA1P53136 463 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W YDC1Q02896 317 aa7.63□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W NNT1Q05874 261 aa7.63□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W SNX3Q08826 162 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W RPS13P05756 151 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W SNF6P18888 332 aa7.62□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W MCH2P36032 473 aa7.62□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data7.62□□□□□ -1.19not detected
YLR349WYLR349W TCM62P38228 572 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W RPS20P38701 121 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W ATF1P40353 525 aa7.62□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W SLM1P40485 686 aa7.62□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W HMS2P47175 358 aa7.62□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W YGL101WP53144 215 aa7.62□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W BRE4Q07660 1125 aa7.62□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W YOR029WQ12243 111 aa7.62□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W YPR071WQ12346 211 aa7.62□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W YCR041WP37265 110 aa7.61□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W PSD1P39006 500 aa7.61□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W PHO90P39535 881 aa7.61□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W QRI7P43122 407 aa7.61□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W WSC2P53832 503 aa7.61□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W RNH201P53942 307 aa7.61□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W RSM23Q01163 450 aa7.61□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W YDL009CQ12210 107 aa7.61□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W RRI1Q12468 440 aa7.61□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W CDC10P25342 322 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W ACH1P32316 526 aa7.6□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W IES6P32617 166 aa7.6□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W RPC34P32910 317 aa7.6□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W SUR1P33300 382 aa7.6□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W PRY2P36110 329 aa7.6□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W SCW11P53189 542 aa7.6□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W ARG5,6Q01217 863 aa7.6□□□□□ -1.19
YLR349WYLR349W AIM36Q03798 255 aa7.6□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 28.5 ms