RNA–Protein interactions for RNA: YBL093C

ROX3, Transcript of Subunit of the RNA polymerase II mediator complex, yeast

Gene ROX3, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ROX3	YBL093C	SNC1	P31109	117 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YEF1	P32622	495 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	MDL1	P33310	695 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	SHE1	P38200	338 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YHR035W	P38769	630 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	NSG1	P38837	291 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	NVJ1	P38881	321 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	UME6	P39001	836 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YIL067C	P40514	678 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	IDS2	P46958	469 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	COS10	P52924	374 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	MKC7	P53379	596 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	MNT4	P53745	580 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YNR062C	P53748	327 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	PGA1	P53896	198 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YLR460C	P54007	376 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	RCF1	Q03713	159 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	SPC19	Q03954	165 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	PLM2	Q04383	521 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	MGR3	Q04472	501 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	MED2	Q12124	431 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	PCL9	Q12477	304 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	COX1	P00401	534 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	JEN1	P36035	616 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	HXT9	P40885	567 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	SNO3	P43544	222 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	MDV1	P47025	714 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	ASK10	P48361	1146 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	HXT11	P54862	567 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	DML1	Q03652	475 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	MLC2	Q06580	163 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	CYK3	Q07533	885 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	MCP1	Q12106	302 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	SET6	Q12529	373 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	HSP30	P25619	332 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	HSP150	P32478	413 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	FCY21	P40039	528 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	HIS6	P40545	261 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	CIN1	P40987	1014 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	GDS1	P41913	522 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YFR054C	P43622	192 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	MDE1	P47095	244 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YAT1	P80235	687 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	SNO4	Q04902	237 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	SEI1	Q06058	285 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	HSP32	Q08992	237 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	RCN2	Q12044	265 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YDL109C	Q12103	647 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	IRA1	P18963	3092 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	NPL6	P32832	435 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	TRS65	P32893	560 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	ECT1	P33412	323 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	MSN4	P33749	630 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	NIC96	P34077	839 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	ZRT3	P34240	503 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	GPX1	P36014	167 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YKL071W	P36086	256 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	MAL32	P38158	584 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YHK8	P38776	514 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
ROX3	YBL093C	FMC1	P40491	155 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	MAL12	P53341	584 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	RRN9	P53437	365 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	EKI1	Q03764	534 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	TAZ1	Q06510	381 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	IPK1	Q06667	281 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	COQ10	Q08058	207 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	RDR1	Q08904	546 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YOS9	Q99220	542 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	THI2	P38141	450 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	CUP9	P41817	306 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	YJL055W	P47044	245 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	MRH4	P53166	561 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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