RNA–Protein interactions for RNA: YOL003C

PFA4, Transcript of Palmitoyltransferase with autoacylation activity, yeastyeast

Gene PFA4, Length 1,137 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFA4YOL003C RIO2P40160 425 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PFA4YOL003C CIN2P46670 268 aa3.78□□□□□ -1.8
PFA4YOL003C USE1P53146 245 aa3.78□□□□□ -1.8
PFA4YOL003C YNL134CP53912 376 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PFA4YOL003C REX2P54964 269 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PFA4YOL003C MRPS16Q02608 121 aa3.78□□□□□ -1.8
PFA4YOL003C RNY1Q02933 434 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PFA4YOL003C YMR209CQ03648 457 aa3.78□□□□□ -1.8
PFA4YOL003C GAT3Q07928 141 aa3.78□□□□□ -1.8
PFA4YOL003C DDC1Q08949 612 aa3.78□□□□□ -1.8
PFA4YOL003C TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PFA4YOL003C RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C GCD2P12754 651 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C SEC14P24280 304 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C GIT1P25346 518 aa3.77□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C RSA4P25382 515 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C FAA1P30624 700 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C KDX1P36005 433 aa3.77□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C SHE3P38272 425 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C PHO89P38361 574 aa3.77□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C AIM18P38884 321 aa3.77□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C TRF5P48561 642 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C EOS1P53938 366 aa3.77□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C KTR6P54070 446 aa3.77□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C SLT2Q00772 484 aa3.77□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C FMN1Q03778 218 aa3.77□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C LDB17Q12342 491 aa3.77□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C STE7P06784 515 aa3.76□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C VAM7P32912 316 aa3.76□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C MID2P36027 376 aa3.76□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C DAD2P36162 133 aa3.76□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C GPI18P38211 433 aa3.76□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C TRM5P38793 499 aa3.76□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C PFS1P38872 237 aa3.76□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C FRT2P39734 528 aa3.76□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C YIL001WP40560 513 aa3.76□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C YPS5P53057 165 aa3.76□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C PEX31P53203 462 aa3.76□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C COS6P53344 381 aa3.76□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C RCF2P53721 224 aa3.76□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C OSH6Q02201 448 aa3.76□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C YPL107WQ02873 248 aa3.76□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C YDR476CQ03362 224 aa3.76□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C APC9Q12107 265 aa3.76□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C RGS2Q99188 309 aa3.76□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C CBP6P07253 162 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C SCH9P11792 824 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C MET16P18408 261 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C UBA1P22515 1024 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C BUD2P33314 1104 aa3.75□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C YHL026CP38740 315 aa3.75□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C TVP23P38962 199 aa3.75□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C PRM9P39551 298 aa3.75□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C LYS12P40495 371 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C IGD1P43598 195 aa3.75□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C VHT1P53241 593 aa3.75□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C YNR068CP53754 272 aa3.75□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C TVP15Q03860 143 aa3.75□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C CDC123Q05791 360 aa3.75□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C BCP1Q06338 283 aa3.75□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C PEX27Q08580 376 aa3.75□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C APC5Q08683 685 aa3.75□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C YPR202WQ08993 238 aa3.75□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C SFM1Q12314 213 aa3.75□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C OCA6Q12454 224 aa3.75□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C FRE6Q12473 712 aa3.75□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C SFG1Q12507 346 aa3.75□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C YMR030W-AQ3E760 96 aa3.75□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data3.74□□□□□ -1.81not detected
PFA4YOL003C MSK1P32048 576 aa3.74□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C TKL2P33315 681 aa3.74□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C ADH5P38113 351 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C YHI9P38765 294 aa3.74□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C YEL028WP39989 153 aa3.74□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C GVP36P40531 326 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C YFL040WP43562 540 aa3.74□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C MIG2P53035 382 aa3.74□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C YGR016WP53209 190 aa3.74□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C VAC7P53950 1165 aa3.74□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C CSN9Q03981 162 aa3.74□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C MSC3Q05812 728 aa3.74□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C SLD7Q08457 257 aa3.74□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C GPM2Q12008 311 aa3.74□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C YOR338WQ99326 363 aa3.74□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C HIS1P00498 297 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C HEM4P06174 275 aa3.73□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C MRPS28P21771 286 aa3.73□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C DBR1P24309 405 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C SMI1P32566 505 aa3.73□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C ATG12P38316 186 aa3.73□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C URA8P38627 578 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C SEO1P39709 593 aa3.73□□□□□ -1.81
PFA4YOL003C EDC3P39998 551 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.8 ms