RNA–Protein interactions for RNA: YKL095W

YJU2, Transcript of Essential protein required for pre-mRNA splicing, yeast

Gene YJU2, Length 837 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJU2	YKL095W	ATG17	Q06410	417 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	GPM2	Q12008	311 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	SLM3	Q12093	417 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	EAF3	Q12432	401 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	QCR7	P00128	127 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	YCR102C	P25608	368 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	INO2	P26798	304 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	QRI5	P32344	111 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	PDC2	P32896	925 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	YBR241C	P38142	488 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	YAT2	P40017	923 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	YIL029C	P40538	142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	LCB3	P47013	409 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	PEX31	P53203	462 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	IBD2	P53892	351 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	ASI3	P53983	676 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	TAZ1	Q06510	381 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	DSE3	Q08729	430 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	FRE8	Q12209	686 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	YCT1	Q12235	531 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	PRM4	Q12498	284 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJU2	YKL095W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	HEM4	P06174	275 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	YAK1	P14680	807 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	SNF6	P18888	332 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	SSO1	P32867	290 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	NAT2	P37293	288 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	TRM5	P38793	499 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	IKI1	P38874	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	CIN2	P46670	268 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	YDL144C	Q07589	356 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	VIK1	Q12045	647 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	PNS1	Q12412	539 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	TFC7	Q12415	435 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	ATR1	P13090	542 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	MDM10	P18409	493 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	TRS65	P32893	560 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	PMU1	P36069	295 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	NDT80	P38830	627 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	FRT2	P39734	528 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	MAM33	P40513	266 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	PRM15	Q03262	622 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	JLP1	Q12358	412 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	CMK2	P22517	447 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	YBP1	P38315	674 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	IBA57	P47158	497 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	MIC26	P50087	233 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	MGA1	P53050	456 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	NIF3	P53081	288 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	GOR1	P53839	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	TDA1	Q03533	586 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	DPP1	Q05521	289 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	YLR446W	Q06204	433 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	GRE1	Q08969	168 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	TAF10	Q12030	206 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	FCY22	Q12119	530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	DCN1	Q12395	269 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	STH1	P32597	1359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	FUN26	P31381	517 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	ACP1	P32463	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	ATG12	P38316	186 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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