RNA–Protein interactions for RNA: YJL177W

RPL17B, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L17B, yeastyeast

Gene RPL17B, Length 555 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL17BYJL177W MRM2P53123 320 aa2.6□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W PNC1P53184 216 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W RRN9P53437 365 aa2.6□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W SLT2Q00772 484 aa2.6□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W ARO80Q04052 950 aa2.6□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W UBX2Q04228 584 aa2.6□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W PEX12Q04370 399 aa2.6□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W YDR061WQ12298 539 aa2.6□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W VPS63O13549 108 aa2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W HIS3P06633 220 aa2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W PDE2P06776 526 aa2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W ATP1P07251 545 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W CAP2P13517 287 aa2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W ALG1P16661 449 aa2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W DBF2P22204 572 aa2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W SKN1P33336 771 aa2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W YKL097CP34245 136 aa2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W SRP102P36057 244 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W YKL071WP36086 256 aa2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W STP2P38704 541 aa2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W INM1P38710 295 aa2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W FHL1P39521 936 aa2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W MMF1P40185 145 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W GAB1P41733 394 aa2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W EAF6P47128 113 aa2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W GTO1P48239 356 aa2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W MND1P53102 219 aa2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W DIA1P54005 336 aa2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W IRC4Q03036 179 aa2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W DML1Q03652 475 aa2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W CUR1Q06469 252 aa2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W GPN3Q06543 272 aa2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W DTD1Q07648 150 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W YLL007CQ07799 665 aa2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W DAS2Q12084 232 aa2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W IZH2Q12442 317 aa2.59□□□□□ -1.99
RPL17BYJL177W RPL24AP04449 155 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W CDC37P06101 506 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W RPL35AP0CX84 120 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W RPL35BP0CX85 120 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W MSI1P13712 422 aa2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W FBA1P14540 359 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W POL30P15873 258 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W SNF6P18888 332 aa2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W COQ1P18900 473 aa2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W PET18P25362 215 aa2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W AST1P35183 429 aa2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W DBP7P36120 742 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W HMT1P38074 348 aa2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W RFT1P38206 574 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W FIG1P38224 298 aa2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W GPI16P38875 610 aa2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W SEN34P39707 275 aa2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W FRT2P39734 528 aa2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W UFE1P41834 346 aa2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W CCC1P47818 322 aa2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W YGL204CP53089 101 aa2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W YGL114WP53134 725 aa2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W NSA1P53136 463 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W ORM1P53224 222 aa2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W CUS2P53830 285 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W YNL143CP53908 130 aa2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W NSE1Q07913 336 aa2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W SMC5Q08204 1093 aa2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W BTS1Q12051 335 aa2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W JID1Q12350 301 aa2.58□□□□□ -2
RPL17BYJL177W RAD1P06777 1100 aa2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W QCR2P07257 368 aa2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W NHP6BP11633 99 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W UGA1P17649 471 aa2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W PPA2P28239 310 aa2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W NUP2P32499 720 aa2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W FES1P38260 290 aa2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W AME1P38313 324 aa2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W SSH1P38353 490 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W YER186CP40101 306 aa2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W ATM1P40416 690 aa2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W SLM1P40485 686 aa2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W MAM33P40513 266 aa2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W HAC1P41546 238 aa2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W YFR057WP43625 151 aa2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W LCB3P47013 409 aa2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W YHC3P47040 408 aa2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W AIM24P47127 394 aa2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W TAF6P53040 516 aa2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W YGL159WP53110 370 aa2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W ROG1P53118 685 aa2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data2.57□□□□□ -2not detected
RPL17BYJL177W SPR6Q01684 191 aa2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W CTF19Q02732 369 aa2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W RIF2Q06208 395 aa2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W CTS2Q06350 511 aa2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W SDO1Q07953 250 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RPL17BYJL177W YOL019WQ08157 551 aa2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.6 ms