RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP4	YHR069C	YLR040C	Q07988	224 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	PNS1	Q12412	539 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	ENA5	Q12691	1091 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	MTR10	Q99189	972 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	NUM1	Q00402	2748 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.11	□□□□□ -1.59	not detected
RRP4	YHR069C	NAS2	P40555	220 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	REE1	P40893	198 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	MDE1	P47095	244 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	YGR126W	P53274	230 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	YPL039W	Q03080	316 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	SNZ1	Q03148	297 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	SDC1	Q03323	175 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	YMR087W	Q04299	284 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	TAZ1	Q06510	381 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	YPL191C	Q08930	360 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	VCX1	Q99385	411 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	BLM10	P43583	2143 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	STE12	P13574	688 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	PHO80	P20052	293 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	MDH2	P22133	377 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	YME2	P32843	850 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	COS9	P36034	407 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	MDM31	P38880	579 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	FET3	P38993	636 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	SHO1	P40073	367 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	GNP1	P48813	663 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	COS10	P52924	374 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	BUD17	P53727	317 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	SPC19	Q03954	165 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	ARP10	Q04549	284 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	ATG17	Q06410	417 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	MRL1	Q06815	381 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	IRC19	Q07843	230 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	YAL064W-B	O13512	126 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.09	□□□□□ -1.59	not detected
RRP4	YHR069C	MRPS28	P21771	286 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	PPA2	P28239	310 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	THI4	P32318	326 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	SUR1	P33300	382 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	MAL32	P38158	584 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	CHS7	P38843	316 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	HIS6	P40545	261 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	SSY5	P47002	699 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	MSY1	P48527	492 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	BRR6	P53062	197 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	MAL12	P53341	584 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	NUP49	Q02199	472 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	SPO19	Q03029	223 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	FIN1	Q03898	291 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	RSM24	Q03976	319 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	MLC2	Q06580	163 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	PCL9	Q12477	304 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	MEC1	P38111	2368 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RRP4	YHR069C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RRP4	YHR069C	OPI3	P05375	206 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RRP4	YHR069C	UTR1	P21373	530 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RRP4	YHR069C	PUP2	P32379	260 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RRP4	YHR069C	SHE1	P38200	338 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RRP4	YHR069C	APD1	P38281	316 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RRP4	YHR069C	MLH1	P38920	769 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RRP4	YHR069C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RRP4	YHR069C	MNN5	P46982	586 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RRP4	YHR069C	NIT2	P47016	307 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RRP4	YHR069C	YGR066C	P53242	292 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RRP4	YHR069C	MNT4	P53745	580 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RRP4	YHR069C	FDC1	Q03034	503 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RRP4	YHR069C	GAS2	Q06135	555 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RRP4	YHR069C	YLR173W	Q06247	608 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RRP4	YHR069C	YLR352W	Q06479	807 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RRP4	YHR069C	FMP45	Q07651	309 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RRP4	YHR069C	FRE5	Q08908	694 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RRP4	YHR069C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RRP4	YHR069C	HMS1	Q12398	434 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RRP4	YHR069C	PDE2	P06776	526 aa		5.07	□□□□□ -1.6

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