RNA–Protein interactions for RNA: YGR281W

YOR1, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene YOR1, Length 4,434 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOR1	YGR281W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	AGC1	Q12482	902 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	ALG7	P07286	448 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	ERD1	P16151	362 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	PAU2	P32612	120 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	YBR292C	P38357	123 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	STP2	P38704	541 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	ECM34	P38728	170 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	SYS1	P41544	203 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	NBP35	P52920	328 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	RNH1	Q04740	348 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	PAM18	Q07914	168 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	RAX1	Q08760	435 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	SIA1	Q12212	622 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	PST1	Q12355	444 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	FLP1	P03870	423 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	CDC9	P04819	755 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	MRPL9	P31334	269 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	DOA4	P32571	926 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	PAU24	P38155	120 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	RRF1	P38771	230 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	GDS1	P41913	522 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	STE24	P47154	453 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	SSN8	P47821	323 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	PMT5	P52867	743 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	CUZ1	P53899	274 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	ROT1	Q03691	256 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	YFH1	Q07540	174 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	SCEI	P03882	235 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	DBF20	P32328	564 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	PDC2	P32896	925 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	COS9	P36034	407 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	SAF1	P38352	637 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	LTP1	P40347	161 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	MTQ1	P53944	314 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	COX20	Q04935	205 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	ISN1	Q99312	450 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	AI1	P03875	834 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	TRS65	P32893	560 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	YGR210C	P42942	411 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	ZAP1	P47043	880 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	URA6	P15700	204 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	BOS1	P25385	244 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	NDC1	P32500	655 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	APL3	P38065	1025 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	DMA1	P38823	416 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	YNR062C	P53748	327 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	NFI1	Q12216	726 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	LSB5	P25369	354 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	YNL034W	P53963	612 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	ECM18	Q04623	453 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	SMA2	Q04658	369 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	YOL036W	Q08206	761 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	COX17	Q12287	69 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	ERP4	Q12450	207 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	YBR139W	P38109	508 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	PCL6	P40038	420 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	BIO3	P50277	480 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	YIP1	P53039	248 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	BRR6	P53062	197 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	LPP1	Q04396	274 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	SRO7	Q12038	1033 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	ATP16	Q12165	160 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	ISA2	Q12425	185 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	CCZ1	P38273	704 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected

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