RNA–Protein interactions for RNA: YOL044W

PEX15, Transcript of Tail-anchored type II integral peroxisomal membrane protein, yeast

Gene PEX15, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX15	YOL044W	UBX2	Q04228	584 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PEX15	YOL044W	APC4	Q04601	652 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PEX15	YOL044W	FAR10	Q06001	478 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PEX15	YOL044W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PEX15	YOL044W	SIA1	Q12212	622 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PEX15	YOL044W	PRM4	Q12498	284 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PEX15	YOL044W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PEX15	YOL044W	RIB7	P33312	244 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PEX15	YOL044W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.72	□□□□□ -1.97	not detected
PEX15	YOL044W	TAE1	P38340	232 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PEX15	YOL044W	GGC1	P38988	300 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PEX15	YOL044W	RTT105	P40063	208 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PEX15	YOL044W	PMT4	P46971	762 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PEX15	YOL044W	COX16	P47081	118 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PEX15	YOL044W	YGL185C	P53100	379 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PEX15	YOL044W	SNX41	Q04053	625 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PEX15	YOL044W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PEX15	YOL044W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PEX15	YOL044W	STE2	D6VTK4	431 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	GPI12	P23797	304 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	CSM1	P25651	190 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	RRT13	P40042	185 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	BIO4	P53630	237 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	VHS1	Q03785	461 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	API2	Q04413	109 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	ERV41	Q04651	352 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	RAX2	Q12465	1220 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	INO2	P26798	304 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	RCK1	P38622	512 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	ECM34	P38728	170 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	PET8	P38921	284 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	SEO1	P39709	593 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	YOL029C	Q08187	201 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	APC9	Q12107	265 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	ERP3	Q12403	225 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	IZH4	Q99393	312 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	OM45	P16547	393 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	YKL070W	P36087	169 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	MRPS9	P38120	278 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	EFM1	P38732	585 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	GTO1	P48239	356 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	KEL2	P50090	882 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	MND1	P53102	219 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	YNL260C	P53846	198 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	YNL050C	P53952	270 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	MIM1	Q08176	113 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	CYM1	P32898	989 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	MCH2	P36032	473 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	YPC1	P38298	316 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	SLX1	P38324	304 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	CTM1	P38818	585 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	PEX18	P38855	283 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	SWC4	P53201	476 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	FMP48	P53233	369 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	SED5	Q01590	340 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	INP1	Q03694	420 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	BCP1	Q06338	283 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	YDL012C	Q12489	107 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	TIP20	P33891	701 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	HIS2	P38635	335 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	TDA11	P38854	504 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	VPS45	P38932	577 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	YER184C	P39961	794 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	SLM1	P40485	686 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	YFL012W	P43580	148 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	SDS23	P53172	527 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	YNR066C	P53752	436 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	INP2	Q03824	705 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	YMR244W	Q04018	355 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	ASR1	Q06834	288 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	YDR018C	Q12185	396 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	TFC7	Q12415	435 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	FMP16	Q12497	93 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	FLO11	P08640	1367 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	YKL187C	P34231	750 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	YKL063C	P35725	167 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	AGP3	P43548	558 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	YPL077C	Q02831	240 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	ECM11	Q04110	302 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
PEX15	YOL044W	LAG2	Q92325	660 aa		2.66	□□□□□ -1.98

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