RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	ALE1	Q08548	619 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	YOR012W	Q12351	137 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	YOL085C	Q99345	113 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	STE3	P06783	470 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	COY1	P34237	679 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	TCD1	P38756	429 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	RRT13	P40042	185 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	COQ5	P49017	307 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	HOP2	P53187	214 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	SED5	Q01590	340 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	ARR2	Q06597	130 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	RRT8	Q08219	342 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	DDC1	Q08949	612 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	MMT2	Q08970	484 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	TY3A-G	Q12173	290 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	PSY3	Q12318	242 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	TY3A-I	Q99219	290 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	PAN1	P32521	1480 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	STE2	D6VTK4	431 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	SAG1	P20840	650 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	HXT2	P23585	541 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	MXR2	P25566	168 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	ERG9	P29704	444 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	URA10	P30402	227 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	MKK1	P32490	508 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	YKL071W	P36086	256 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	PCH2	P38126	564 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	PEX32	P38292	413 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	EFM1	P38732	585 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	GGC1	P38988	300 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	FHL1	P39521	936 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	RPN14	P53196	417 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	ABZ2	Q03266	374 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	SCS7	Q03529	384 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	API2	Q04413	109 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	ARR1	Q06596	294 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	VAC14	Q06708	880 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	RGS2	Q99188	309 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	UFD4	P33202	1483 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	SCC2	Q04002	1493 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	2.17	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	2.16	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	2.16	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	UTR1	P21373	530 aa		2.16	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	ZIP1	P31111	875 aa		2.16	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	2.16	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	2.16	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	YEL043W	P32618	956 aa		2.16	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	COT1	P32798	439 aa		2.16	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.16	□□□□□ -2.06	not detected
YLR224W	YLR224W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	2.16	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	ECM4	P36156	370 aa		2.16	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	MRPL37	P36532	105 aa		2.16	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	NAS2	P40555	220 aa		2.16	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	2.16	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	2.16	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	2.16	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	2.16	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	YLR413W	Q06689	675 aa		2.16	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	2.16	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	GIS3	Q12418	502 aa		2.16	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		2.16	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		2.16	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	CCH1	P50077	2039 aa		2.15	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	RAD1	P06777	1100 aa		2.15	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	YLL053C	P0CD98	152 aa		2.15	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	2.15	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	2.15	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	CIN8	P27895	1000 aa		2.15	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	2.15	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	2.15	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	MSN4	P33749	630 aa		2.15	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	TIP20	P33891	701 aa		2.15	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	SRB2	P34162	210 aa		2.15	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	FRT2	P39734	528 aa		2.15	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	YCH1	P42937	148 aa		2.15	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	RTC4	P53850	401 aa		2.15	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	YNL146W	P53906	100 aa		2.15	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	ECM18	Q04623	453 aa		2.15	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	2.15	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	YOL107W	Q12239	342 aa		2.15	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	AUS1	Q08409	1394 aa		2.14	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	2.14	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	SUA5	P32579	426 aa		2.14	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	2.14	□□□□□ -2.07

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15 ms