RNA–Protein interactions for RNA: YGR281W

YOR1, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene YOR1, Length 4,434 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOR1	YGR281W	IRC24	P40580	263 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	TIM44	Q01852	431 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	MMT2	Q08970	484 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	GPI12	P23797	304 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	TAT1	P38085	619 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	FTH1	P38310	465 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	YJR115W	P47152	169 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	SKP1	P52286	194 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	DAM1	P53267	343 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	RHO4	Q00246	291 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	EKI1	Q03764	534 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	ZRC1	P20107	442 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	IMG1	P25626	169 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	PPA2	P28239	310 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	LYP1	P32487	611 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	AIM26	P32858	118 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	SEF1	P34228	1148 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	SFK1	P35735	353 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	SHE1	P38200	338 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	SSO2	P39926	295 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	BUD9	P53226	547 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	YLR152C	P54072	576 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	HMS1	Q12398	434 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	HCM1	P25364	564 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	ERG3	P32353	365 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	ECM8	P38246	354 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	RMD6	P39975	231 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	HXT14	P42833	540 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	DIE2	P50076	525 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	YPK2	P18961	677 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	RTS2	P40962	232 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	SCS3	P53012	380 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	FRE3	Q08905	711 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	MMP1	Q12372	583 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	KIN28	P06242	306 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	TEC1	P18412	486 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	PHO3	P24031	467 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	ICE2	P40499	491 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	PRM10	P42946	383 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	PGA1	P53896	198 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	FCY22	Q12119	530 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	LCB4	Q12246	624 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	MOD5	P07884	428 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	IRC7	P43623	340 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	CCC1	P47818	322 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	SGF73	P53165	657 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.68	□□□□□ -1.66	not detected
YOR1	YGR281W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	HPF1	Q05164	967 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	LIP2	Q06005	328 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	ARV1	Q06541	321 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	REV1	P12689	985 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	CBS1	P14066	229 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	YCL049C	P25577	312 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	GGC1	P38988	300 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	HIS6	P40545	261 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	REE1	P40893	198 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	PAU12	P53343	120 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	FRE4	P53746	719 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	MHT1	Q12525	324 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	ATG40	Q99325	256 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	HAP4	P14064	554 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	CKA1	P15790	372 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	ERD2	P18414	219 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	SNC2	P33328	115 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	ECT1	P33412	323 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	KKQ8	P36004	724 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	GPX2	P38143	162 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	CIN2	P46670	268 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	LCL3	P53153	274 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	MTL1	P53214	551 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	CPR8	P53728	308 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	SWS2	P53937	143 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOR1	YGR281W	COQ10	Q08058	207 aa		4.67	□□□□□ -1.66

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