RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	CSE1	P33307	960 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	FLO10	P36170	1169 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	RIM2	P38127	377 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	TRM5	P38793	499 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	3.76	□□□□□ -1.81	RIP-Chip
SYF1	YDR416W	PHO90	P39535	881 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	EXO1	P39875	702 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	RPH1	P39956	796 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	GAB1	P41733	394 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	SOL4	P53315	255 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	IRC4	Q03036	179 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	CSM3	Q04659	317 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	PEX10	Q05568	337 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	SRL2	Q12020	392 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YOP1	Q12402	180 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	TRP3	P00937	484 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	ALG7	P07286	448 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	SPO12	P17123	173 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	MBR1	P23493	339 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	SNC1	P31109	117 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	ZRT1	P32804	376 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	FZO1	P38297	855 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YCH1	P42937	148 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	VEL1	P53058	206 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	PLB3	Q08108	686 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YOR389W	Q08912	624 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	PER33	Q12144	273 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	QCR2	P07257	368 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	ITR2	P30606	609 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	ECM15	P35195	104 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YKL063C	P35725	167 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	FIG1	P38224	298 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YER184C	P39961	794 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	KEG1	P43614	200 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YIP1	P53039	248 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	NIF3	P53081	288 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	CPD1	P53314	239 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	PEX12	Q04370	399 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	SGT1	Q08446	395 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	ACF2	Q12168	779 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	LSB5	P25369	354 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	ATO2	P32907	282 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YKL187C	P34231	750 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YHR035W	P38769	630 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	SIM1	P40472	476 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	CAF40	P53829	373 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YPL034W	Q03083	165 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	SLD5	Q03406	294 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YDR209C	Q03480	137 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	ECM11	Q04110	302 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	TMA10	Q06177	86 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	SSK1	Q07084	712 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	RGT2	Q12300	763 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	RPB8	P20436	146 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YCR007C	P25354	239 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	NAM9	P27929	486 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YKE4	P40544	346 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YFR057W	P43625	151 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YJR149W	P47177	404 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	ORC5	P50874	479 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	FRE4	P53746	719 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	CDC14	Q00684	551 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	THI72	Q08579	599 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	SNA3	P14359	133 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	MGA1	P53050	456 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YNL140C	P53910	189 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	SPR6	Q01684	191 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	GIS1	Q03833	894 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	POM33	Q12164	279 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	NCA2	Q12374	616 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	RIB5	P38145	238 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	BMT2	P38278	337 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	BDH2	P39713	417 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YDL218W	Q07629	317 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	HEM15	P16622	393 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	SEN2	P16658	377 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YCR102C	P25608	368 aa		3.73	□□□□□ -1.81

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