RNA–Protein interactions for RNA: YBR257W

POP4, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP4, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP4	YBR257W	REG2	P38232	338 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	ARP1	P38696	384 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	NVJ1	P38881	321 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	VAB2	P40003	282 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	BUR6	P40096	142 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	PUG1	P40100	303 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	AIM22	P47051	409 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	PET130	P47065	347 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YGR026W	P53217	278 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	SHY1	P53266	389 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	RRN9	P53437	365 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	BSC5	P53755	489 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	AIM32	Q04689	311 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	CRF1	Q04930	467 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	VPS74	Q06385	345 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	CDD1	Q06549	142 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	MRPL35	Q06678	367 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	SWC7	Q06707	132 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YLR108C	Q12259	485 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	ERP3	Q12403	225 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	RRI1	Q12468	440 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	SNF8	Q12483	233 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	CTT1	P06115	562 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	PHO2	P07269	559 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	UNG1	P12887	359 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	MET8	P15807	274 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	UTR1	P21373	530 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	APA2	P22108	325 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YCR099C	P25657	155 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	NDC1	P32500	655 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	PDC2	P32896	925 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	VPS17	P32913	551 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	NSG1	P38837	291 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.16	□□□□□ -1.74	not detected
POP4	YBR257W	SEN34	P39707	275 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	HPA3	P39979	161 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	SMK1	P41808	388 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	TDA1	Q03533	586 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YPR063C	Q12160	140 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	PSF1	Q12488	208 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	SIR2	P06700	562 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	DST1	P07273	309 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	MNE1	P24720	663 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ACB1	P31787	87 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	OAC1	P32332	324 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ALY1	P36117	915 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	COS8	P38723	381 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	FET3	P38993	636 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	MET30	P39014	640 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	RCY1	P39531	840 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	SKP2	P42843	763 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	SNG1	P46950	547 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	TIS11	P47977	285 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	NUP100	Q02629	959 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	MSS11	Q03825	758 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	RRN11	Q04712	507 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	APC5	Q08683	685 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	CTF3	Q12748	733 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ARG80	P07249	177 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	MET2	P08465	486 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	GLN3	P18494	730 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	SRB6	P32570	121 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	SEC17	P32602	292 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	SFC1	P33303	322 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YBR063C	P38083	404 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	SIF2	P38262	535 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	LAG1	P38703	411 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	EFM1	P38732	585 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	IKI1	P38874	309 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	MDM31	P38880	579 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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