RNA–Protein interactions for RNA: tS(GCU)Q1

tS(GCU)Q1, Transcript of Mitochondrial serine tRNA (tRNA-Ser), yeastyeast

Gene tS(GCU)Q1, Length 86 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RAS2P01120 322 aaKnown RBP-1.37□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RAD10P06838 210 aa-1.37□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DSF1P0CX08 502 aa-1.37□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YNR073CP0CX09 502 aa-1.37□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GPA2P10823 449 aa-1.37□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 COS5P47187 383 aa-1.37□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CIK1Q01649 594 aa-1.37□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 APC5Q08683 685 aa-1.37□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YOR268CQ08734 132 aa-1.37□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ATG29Q12092 213 aa-1.37□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SLM3Q12093 417 aa-1.37□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RUP1Q12242 671 aa-1.37□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FBA1P14540 359 aaKnown RBP-1.38□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TOA2P32774 122 aa-1.38□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ZTA1P38230 334 aaKnown RBP-1.38□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BMT5P40493 336 aa-1.38□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YGR266WP53326 701 aa-1.38□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP-1.38□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 STE23Q06010 1027 aa-1.38□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP-1.38□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TPK3P05986 398 aa-1.39□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPS14AP06367 137 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DST1P07273 309 aa-1.39□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PPH22P23595 377 aa-1.39□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GFD2P25370 566 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SCM4P32564 187 aa-1.39□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PEX5P35056 612 aa-1.39□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SIF2P38262 535 aa-1.39□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPS14BP39516 138 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YHB1P39676 399 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 OSH6Q02201 448 aa-1.39□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPN9Q04062 393 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NAT4Q04751 285 aa-1.39□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RQC1Q05468 723 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YLH47Q06493 454 aa-1.39□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AQY2P0CD90 149 aa-1.4□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SRP72P38688 640 aaKnown RBP-1.4□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YER079WP40052 210 aaKnown RBP-1.4□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BUD25P85052 153 aa-1.4□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GTR1Q00582 310 aa-1.4□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RRB1Q04225 511 aaKnown RBP-1.4□□□□□ -2.63
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VPH2P32341 215 aa-1.41□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RRN3P36070 627 aa-1.41□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BYE1P36106 594 aa-1.41□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DSE1P40077 573 aa-1.41□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TIF34P40217 347 aaKnown RBP-1.41□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ATM1P40416 690 aa-1.41□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PAC11P40960 533 aa-1.41□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TRM82Q03774 444 aa-1.41□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 COS7Q07788 383 aa-1.41□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SIL1Q08199 421 aa-1.41□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SCL1P21243 252 aaKnown RBP-1.42□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NOP4P37838 685 aaKnown RBP-1.42□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DOT5P40553 215 aa-1.42□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SAP185P40856 1058 aa-1.42□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MRX6P48564 524 aa-1.42□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YNR062CP53748 327 aa-1.42□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DON1Q05610 365 aa-1.42□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RRP45Q05636 305 aaKnown RBP-1.42□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VTA1Q06263 330 aa-1.42□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NFI1Q12216 726 aa-1.42□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ARF1P11076 181 aaKnown RBP-1.43□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MET8P15807 274 aa-1.43□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 UGX2P32772 223 aa-1.43□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PRM10P42946 383 aa-1.43□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CAK1P43568 368 aaPredicted RBP-1.43□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 OST3P48439 350 aa-1.43□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GLE1Q12315 538 aa-1.43□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ISA2Q12425 185 aa-1.43□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DOA1P36037 715 aa-1.44□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YER076CP40049 302 aa-1.44□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 EFM4P40516 257 aa-1.44□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YJR079WP47126 109 aa-1.44□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PRM15Q03262 622 aa-1.44□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PRP42Q03776 544 aaKnown RBP-1.44□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NSE1Q07913 336 aa-1.44□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 COX3P00420 269 aa-1.45□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PBN1P25580 416 aa-1.45□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PCH2P38126 564 aa-1.45□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NTC20P38302 140 aaPredicted RBP-1.45□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NNT1Q05874 261 aa-1.45□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GAT3Q07928 141 aa-1.45□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PEX4P29340 183 aa-1.46□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SYS1P41544 203 aa-1.46□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TIM21P53220 239 aa-1.46□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ERB1Q04660 807 aaKnown RBP-1.46□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data-1.46□□□□□ -2.64not detected
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 UBA3Q99344 299 aa-1.46□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 REP1P03871 373 aa-1.47□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DDI2P0CH63 225 aa-1.47□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DDI3P0CH64 225 aa-1.47□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP-1.47□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPL12BP0CX54 165 aa-1.47□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CLC1P17891 233 aa-1.47□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 OCA4P25366 362 aa-1.47□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RRP7P25368 297 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PTH2P34222 208 aa-1.47□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SPL2P38839 148 aa-1.47□□□□□ -2.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PES4P39684 611 aa-1.47□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 46.9 ms