RNA–Protein interactions for RNA: YHR120W

MSH1, Transcript of DNA-binding protein of the mitochondria, yeast

Gene MSH1, Length 2,880 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSH1	YHR120W	YGR210C	P42942	411 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	IRC18	P47056	224 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	MRPL50	P53724	139 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	RIM13	Q03792	727 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	SKS1	Q12505	502 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	CDC9	P04819	755 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	ATG22	P25568	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	RSM22	P36056	628 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	PZF1	P39933	429 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	SMA2	Q04658	369 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	CDA2	Q06703	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	FDH1	Q08911	376 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YOR214C	Q12282	236 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	QCR7	P00128	127 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	AAC3	P18238	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	GPI12	P23797	304 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	HYM1	P32464	399 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	MTC2	P34246	357 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	ALG3	P38179	458 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YBR242W	P38331	238 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	PHB1	P40961	287 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	PAC10	P48363	199 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	TPC1	P53257	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	TDA1	Q03533	586 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	MEC1	P38111	2368 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	CYT1	P07143	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	NDC1	P32500	655 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	VPS51	P36116	164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	IFA38	P38286	347 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YTA6	P40328	754 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	LAS21	P40367	830 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	ISU1	Q03020	165 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	AIM36	Q03798	255 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	RNH202	Q05635	350 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	ENV7	Q12003	364 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	MMP1	Q12372	583 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	PET54	P10834	293 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	RPC34	P32910	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	NAT2	P37293	288 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YBR063C	P38083	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	MOH1	P38191	138 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	OM14	P38325	134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	VMA7	P39111	118 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	MRPS18	P42847	217 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YFL066C	P43538	392 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	UBX6	P47049	396 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	FDC1	Q03034	503 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	AI1	P03875	834 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	TAT1	P38085	619 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	MLH1	P38920	769 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	ALP1	P38971	573 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	APS3	P47064	194 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	BUD17	P53727	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	ATG21	Q02887	496 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	RSM28	Q03430	361 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	MRPL35	Q06678	367 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YNG1	Q08465	219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	FMP16	Q12497	93 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	MKK1	P32490	508 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	GID8	P40208	455 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YJL068C	P40363	299 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	RRN9	P53437	365 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	BUR2	Q05949	395 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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