RNA–Protein interactions for RNA: YHR077C

NMD2, Transcript of Protein involved in the nonsense-mediated mRNA decay (NMD) pathway, yeast

Gene NMD2, Length 3,270 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NMD2	YHR077C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.74	□□□□□ -1.97	not detected
NMD2	YHR077C	AGA2	P32781	87 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	PAU24	P38155	120 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	MAL32	P38158	584 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	YHR035W	P38769	630 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	GEP4	P38812	185 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	BNA6	P43619	295 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	MAL12	P53341	584 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	SUN4	P53616	420 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	ALG12	P53730	551 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	YKR011C	Q02209	353 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	INP53	Q12271	1107 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	QCR7	P00128	127 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	AI1	P03875	834 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	COX9	P07255	59 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	YPK2	P18961	677 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	DIT1	P21623	536 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	YCR006C	P25350	157 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	ATS1	P31386	333 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	PRO1	P32264	428 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	DOA4	P32571	926 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	TIM12	P32830	109 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	ORC2	P32833	620 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	YOR062C	P36025	268 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	SRX1	P36077	127 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	FLO10	P36170	1169 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	RPS27B	P38711	82 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	SKN7	P38889	622 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	ICE2	P40499	491 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	HIS6	P40545	261 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	ATG18	P43601	500 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	MNN5	P46982	586 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	PMT5	P52867	743 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	RRN9	P53437	365 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	KEI1	Q06346	221 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	YPR127W	Q06494	345 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	YLR125W	Q12138	136 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	APC2	Q12440	853 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	SET6	Q12529	373 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	SPS2	P08459	502 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	ERD2	P18414	219 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	PHO80	P20052	293 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	DTR1	P38125	572 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	YIL060W	P40519	144 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	PKP1	P40530	394 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	DOC1	P53068	250 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	ASI3	P53983	676 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	PLP1	Q04004	230 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	YDR514C	Q04408	483 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	SPR28	Q04921	423 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	YFT2	Q06676	274 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	SSK1	Q07084	712 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	YOR365C	Q08844	703 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	FDH1	Q08911	376 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	ISU2	Q12056	156 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	BBP1	Q12365	385 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	NPC2	Q12408	173 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	PCL9	Q12477	304 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	FMP16	Q12497	93 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	URA3	P03962	267 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	OPI3	P05375	206 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	KIN28	P06242	306 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	PRB1	P09232	635 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	PRE4	P30657	266 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	PPG1	P32838	368 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	YPT7	P32939	208 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	UTH1	P36135	365 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	TRR2	P38816	342 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	FMP52	P40008	231 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	YIL165C	P40446	119 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NMD2	YHR077C	YFR054C	P43622	192 aa		2.73	□□□□□ -1.97

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