RNA–Protein interactions for RNA: YFR049W

YMR31, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene YMR31, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR31	YFR049W	HMS1	Q12398	434 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YMR31	YFR049W	YDL199C	Q12407	687 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YMR31	YFR049W	IZH4	Q99393	312 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YMR31	YFR049W	RAD3	P06839	778 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	MSF1	P08425	469 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	MSI1	P13712	422 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	CWP1	P28319	239 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	SUA5	P32579	426 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	YKL063C	P35725	167 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	PRM9	P39551	298 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	YIA6	P40556	373 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	IDP2	P41939	412 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	YFL040W	P43562	540 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	BIO3	P50277	480 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	KAP114	P53067	1004 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	TRM82	Q03774	444 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	INP2	Q03824	705 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	SNX41	Q04053	625 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	PBA1	Q05778	276 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	BOP2	Q06150	570 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	RIF2	Q06208	395 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	FRE8	Q12209	686 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	RPN6	Q12377	434 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	CTA1	P15202	515 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	DAL82	P21705	255 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	INO2	P26798	304 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	FUN26	P31381	517 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	SRB4	P32569	687 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	DOA4	P32571	926 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	CSE2	P33308	149 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	BIG1	P38813	335 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	PEX22	P39718	180 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	FMC1	P40491	155 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	YFR057W	P43625	151 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	MST27	P53176	234 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	TIM21	P53220	239 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	CPD1	P53314	239 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	YPL077C	Q02831	240 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	FSH2	Q05015	223 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	YDL114W	Q07530	308 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	PPT2	Q12036	173 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	YOR029W	Q12243	111 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	2.26	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	COX2	P00410	251 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	REP1	P03871	373 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	PET123	P17558	318 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	CPR3	P25719	182 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	RCK2	P38623	610 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	YER085C	P40058	173 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	COA1	P40452	197 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	EGT2	P42835	1041 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	BIR1	P47134	954 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	SWC4	P53201	476 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	CLD1	P53264	445 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	SHY1	P53266	389 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	CRH1	P53301	507 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	OST6	Q03723	332 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	YLR012C	Q07927	99 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	SLM3	Q12093	417 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	TFC7	Q12415	435 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	GIS3	Q12418	502 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	SAL1	D6W196	494 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	ATP6	P00854	259 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	PRB1	P09232	635 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	2.24	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	VPS3	P23643	1011 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YMR31	YFR049W	URA10	P30402	227 aa		2.24	□□□□□ -2.05

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