RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C CBP2P03874 630 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C BCY1P07278 416 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C CHO1P08456 276 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C MSS18P08593 268 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C UGA1P17649 471 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C DAP2P18962 818 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C REC107P21651 314 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C DAL82P21705 255 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C CHA1P25379 360 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SPB1P25582 841 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SSH4P32343 579 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C TFC1P32367 649 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C DPH5P32469 300 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C NUP2P32499 720 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C TAF14P35189 244 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C DOA1P36037 715 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SDS22P36047 338 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RCK1P38622 512 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C STP2P38704 541 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C MDM31P38880 579 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C MNN9P39107 395 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C PRP39P39682 629 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C AIM2P39721 246 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C MTW1P39731 289 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ALG5P40350 334 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C JEM1P40358 645 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C LYS12P40495 371 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YIL086CP40503 102 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C TRM9P49957 279 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C KEL2P50090 882 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C GPI1P53306 609 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C CSL4P53859 292 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YNL033WP53964 284 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YNL019CP53975 284 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RHO4Q00246 291 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SVL3Q03088 825 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C EKI1Q03764 534 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SPC2Q04969 178 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RQC1Q05468 723 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C GMC2Q06201 188 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ASA1Q06822 443 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C COS7Q07788 383 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YLR036CQ07986 203 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C MUM3Q08750 479 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SEC39Q12745 709 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RPL24AP04449 155 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C MXR2P25566 168 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YCL049CP25577 312 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C PEX3P28795 441 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SIN4P32259 974 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C PRP8P33334 2413 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C MSN2P33748 704 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C WBP1P33767 430 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C AUR1P36107 401 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SKG1P36169 355 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C STT4P37297 1900 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C PDX3P38075 228 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ZTA1P38230 334 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YHR177WP38867 453 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YHR210CP38893 341 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ECM10P39987 644 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C FAU1P40099 211 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RIC1P40395 1056 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C HXT9P40885 567 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data2.04□□□□□ -2.08not detected
GCN4YEL009C DIM1P41819 318 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ELP2P42935 788 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C STE24P47154 453 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C JHD2P47156 728 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ASK10P48361 1146 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C PAC10P48363 199 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C CDH1P53197 566 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YGR266WP53326 701 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C COS6P53344 381 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C OAZ1Q02803 292 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ARR1Q06596 294 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C GPI11Q06636 219 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C MFG1Q07684 458 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C TEN1Q07921 160 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SKS1Q12505 502 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YOR019WQ99248 730 aa2.04□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C MF(ALPHA)1P01149 165 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C PUT2P07275 575 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RIP1P08067 215 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C GAL3P13045 520 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C MER1P16523 270 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RPB5P20434 215 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C CMK2P22517 447 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C STE50P25344 346 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C CMK1P27466 446 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C FAA1P30624 700 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ARP2P32381 391 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C MKK1P32490 508 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RPS27AP35997 82 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C CAB3P36076 571 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RPS27BP38711 82 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C TRR2P38816 342 aa2.03□□□□□ -2.08
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