RNA–Protein interactions for RNA: YDR289C

RTT103, Transcript of Protein involved in transcription termination by RNA polymerase II, yeast

Gene RTT103, Length 1,230 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTT103	YDR289C	RAD3	P06839	778 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTT103	YDR289C	CWP1	P28319	239 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTT103	YDR289C	DOA4	P32571	926 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTT103	YDR289C	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RTT103	YDR289C	SDH3	P33421	198 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTT103	YDR289C	YKL071W	P36086	256 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTT103	YDR289C	YGR210C	P42942	411 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTT103	YDR289C	CIN2	P46670	268 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTT103	YDR289C	YAR1	P46683	200 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTT103	YDR289C	TIM21	P53220	239 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTT103	YDR289C	MTM1	P53320	366 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTT103	YDR289C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RTT103	YDR289C	YPL077C	Q02831	240 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTT103	YDR289C	YMR209C	Q03648	457 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTT103	YDR289C	GRS2	Q06817	618 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTT103	YDR289C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	DAL82	P21705	255 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	VPS3	P23643	1011 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	SRB4	P32569	687 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	YKL063C	P35725	167 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	NDT80	P38830	627 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	YER085C	P40058	173 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	IDP2	P41939	412 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	YFL040W	P43562	540 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	MNT4	P53745	580 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	CRZ1	P53968	678 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	INP2	Q03824	705 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	YMR027W	Q04371	470 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	POM33	Q12164	279 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	HMS1	Q12398	434 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	CTA1	P15202	515 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	FUN26	P31381	517 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	YIL067C	P40514	678 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	TRM82	Q03774	444 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	SNX41	Q04053	625 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	RPN6	Q12377	434 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	YDL199C	Q12407	687 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	SAC3	P46674	1301 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	REP1	P03871	373 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	MSI1	P13712	422 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	PET123	P17558	318 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	CYM1	P32898	989 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	COA1	P40452	197 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	YIA6	P40556	373 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	MST27	P53176	234 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	CGR1	P53188	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	SWC4	P53201	476 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	YLR012C	Q07927	99 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	FRE8	Q12209	686 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	ATG31	Q12421	196 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	ERD1	P16151	362 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	RRT12	P25381	491 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	RCK2	P38623	610 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	BIG1	P38813	335 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	PMT4	P46971	762 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	CLD1	P53264	445 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	CPD1	P53314	239 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	MRPL50	P53724	139 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	GAS2	Q06135	555 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	RIF2	Q06208	395 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	PAM18	Q07914	168 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	PPT2	Q12036	173 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	TIP41	Q12199	356 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	YOR029W	Q12243	111 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	KRE6	P32486	720 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	NUP2	P32499	720 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	RPC37	P36121	282 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	MSS2	P40990	351 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	SHY1	P53266	389 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	SLM3	Q12093	417 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	SAL1	D6W196	494 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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