RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W YPR097WQ06839 1073 aa7.02□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W TY1A-BRQ12217 440 aa7.02□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W TY1A-NL2Q12470 440 aa7.02□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W TY1A-GR2Q12485 440 aa7.02□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W SEC2P17065 759 aa7.01□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W PHO87P25360 923 aa7.01□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W ERP5P38819 212 aa7.01□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W IPL1P38991 367 aa7.01□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W KAR5Q04746 504 aa7.01□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W NCR1Q12200 1170 aa7.01□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W SEC20P28791 383 aa7□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W SOH1P38633 127 aa7□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W YJL171CP46992 396 aa7□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W YPR084WQ06821 456 aa7□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W HAP4P14064 554 aa6.99□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W TPS3P38426 1054 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W ARH1P48360 493 aa6.99□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W ORC1P54784 914 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W PDC1P06169 563 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W PAM1P37304 830 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W MET10P39692 1035 aa6.98□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W PAC1P39946 494 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W KXD1P53158 218 aa6.98□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W CWC15Q03772 175 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W PUF6Q04373 656 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W ASF1P32447 279 aa6.97□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W ACS2P52910 683 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W MSC6Q08818 692 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W GRS1P38088 690 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W SAP30P38429 201 aa6.95□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W RRN7P40992 514 aa6.95□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W APL6P46682 809 aa6.95□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W ROM1P53046 1155 aa6.95□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W BNI4P53858 892 aa6.95□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W ITT1Q04638 464 aa6.95□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W PAT1P25644 796 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W YHL050CP38721 697 aa6.94□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W YHR219WP38900 624 aa6.94□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W YDR344CQ05510 147 aa6.94□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W PNP1Q05788 311 aa6.94□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W TSC13Q99190 310 aa6.94□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W PRT1P06103 763 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W TRL1P09880 827 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W PDI1P17967 522 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W HXT10P43581 546 aa6.93□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W PUN1Q06991 263 aa6.93□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W GAS4Q08271 471 aa6.93□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W FKH1P40466 484 aa6.92□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W MDJ2P42834 146 aa6.92□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W SRS2P12954 1174 aa6.91□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W SPT23P35210 1082 aa6.91□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W PTC2P39966 464 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W ATG1P53104 897 aa6.91□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W FUR4P05316 633 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W VAN1P23642 535 aa6.9□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W VAC17P25591 423 aa6.9□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W IXR1P33417 597 aa6.9□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W BOL3P39724 118 aa6.9□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W ALD2P47771 506 aa6.9□□□□□ -1.3
YKR047WYKR047W MIP1P15801 1254 aa6.89□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W THI12P42883 340 aa6.89□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W THI5P43534 340 aa6.89□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W YFL034WP43564 1073 aa6.89□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W POL32P47110 350 aa6.89□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W THI11P47183 340 aa6.89□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W ISR1Q06098 443 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W THI13Q07748 340 aa6.89□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data6.89□□□□□ -1.31not detected
YKR047WYKR047W YPR015CQ12531 247 aa6.89□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W TPD3P31383 635 aa6.88□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W GLO3P38682 493 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W PPX1P38698 397 aa6.88□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W HAL5P38970 855 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W RRD1P40454 393 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W TRS33Q99394 268 aa6.88□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W AIM9P40053 627 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W QDR1P40475 563 aa6.86□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W RGA2Q06407 1009 aa6.86□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W WHI5Q12416 295 aa6.86□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W ATE1P16639 503 aa6.85□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W HDA3Q06623 655 aa6.85□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W ALD4P46367 519 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W ACF4P47129 309 aa6.84□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W NUT2Q06213 157 aa6.84□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W ATG20Q07528 640 aa6.84□□□□□ -1.31
YKR047WYKR047W NTH2P35172 780 aa6.83□□□□□ -1.32
YKR047WYKR047W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
YKR047WYKR047W CWH41P53008 833 aa6.82□□□□□ -1.32
YKR047WYKR047W MOD5P07884 428 aa6.81□□□□□ -1.32
YKR047WYKR047W FRT1Q99332 602 aa6.81□□□□□ -1.32
YKR047WYKR047W CYT1P07143 309 aa6.8□□□□□ -1.32
YKR047WYKR047W UBP1P25037 809 aa6.8□□□□□ -1.32
YKR047WYKR047W KIP2P28743 706 aa6.8□□□□□ -1.32
YKR047WYKR047W SUV3P32580 737 aa6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.2 ms