RNA–Protein interactions for RNA: YKL050C

YKL050C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKL050C, Length 2,769 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL050C	YKL050C	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	VPS29	P38759	282 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	ALD2	P47771	506 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	YPR204W	Q08995	1032 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	YBL036C	P38197	257 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	IPL1	P38991	367 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	TSR4	P25040	408 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	TOA1	P32773	286 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	PPG1	P32838	368 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	EDS1	P38073	919 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	VHR2	P40041	505 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.68	□□□□□ -1.66	RIP-Chip
YKL050C	YKL050C	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	YSP2	Q06681	1438 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	SIS2	P36024	562 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	SCY1	P53009	804 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	TPM2	P40414	161 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	RTT106	P40161	455 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	STH1	P32597	1359 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	HIF1	Q12373	385 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	THI12	P42883	340 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	THI5	P43534	340 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	THI11	P47183	340 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	YMR196W	Q04336	1088 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	THI13	Q07748	340 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	PTC3	P34221	468 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	YML083C	Q04526	418 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	PUP1	P25043	261 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	POL32	P47110	350 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	GAL11	P19659	1081 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	STS1	P38637	319 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	BIO2	P32451	375 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	TEA1	P47988	759 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	YDL121C	Q07541	149 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	YCK3	P39962	524 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	ALG12	P53730	551 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	YOL057W	Q08225	711 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	RAD54	P32863	898 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	AIM21	P40563	679 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	ATH1	P48016	1211 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	YBT1	P32386	1661 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	ATE1	P16639	503 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	BOI2	P39969	1040 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	YGL081W	P53156	320 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	RAD2	P07276	1031 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	ERP2	P39704	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	YNL108C	P53929	270 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	CIT2	P08679	460 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	ISW1	P38144	1129 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	ERP5	P38819	212 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	YDR090C	Q03193	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	YMR074C	Q04773	145 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	YOR238W	Q08634	303 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL050C	YKL050C	CSE4	P36012	229 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	KAR1	P11927	433 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	SEC8	P32855	1065 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	PPX1	P38698	397 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
YKL050C	YKL050C	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	GRX4	P32642	244 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	YHL050C	P38721	697 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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